YcaO
| YcaO-liknande familj | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur för heterocyklaset TruD. Ett YcaO-liknande protein från Prochloron sp. 06037A PDB-post <a i=5>Identifierare
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | YcaO | ||||||||
| Pfam | PF02624 | ||||||||
| InterPro | IPR003776 | ||||||||
| |||||||||
YcaO är ett protein som finns i bakterier som är involverat i syntesen av tiazol/oxazolmodifierade mikrocinantibiotika , såsom bottromycin . YcaO utför ATP- beroende cyklodehydrering för att bilda oxazol- och tiazoldelarna i mikrocinet.
YcaO-namnets ursprung kommer från en rubrik för gennamn som etablerades från bakterien Escherichia coli . Om en gen har en okänd funktion fick den ett namn på fyra bokstäver som börjar med bokstaven Y och de följande tre bokstäverna ges baserat på den genomiska platsen.
Metylkoenzym M-reduktas (MCR) eller koenzym-B-sulfoetyltiotransferas är ett protein som är känt vid tioamidering (en posttranslationell modifiering). Ett Ycao-enzym som är beroende av ATP behövs för MCR-tioamidering samt en sulfidkälla. YcaO-enzymer behövs för att katalysera den ATP-beroende cyklodehydreringen av ryggraden av polära aminosyror som cystein , serin och treonin till den korrekta tiazolin- och (metyl)oxazolin- heterocykeln . Sidokedjorna av dessa aminosyror kan fungera som nukleofiler . Tiolgruppen i cystein och hydroxylgruppen i serin och treonin är starka nukleofiler .