Microcin
| Subtilosin_A | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktur av Subtilosin A-
| |||||||||
| identifierare | |||||||||
| Symbol | Subtilosin_A | ||||||||
| Pfam | PF11420 | ||||||||
| InterPro | IPR021539 | ||||||||
| TCDB | 1.C.84 | ||||||||
| OPM superfamilj | 379 | ||||||||
| OPM-protein | 1pxq | ||||||||
| |||||||||
Mikrociner är mycket små bakteriociner , sammansatta av relativt få aminosyror . Av denna anledning skiljer de sig från sina större proteinkusiner . Det klassiska exemplet är mikrocin V, av Escherichia coli . Subtilosin A är ett annat bakteriocin från Bacillus subtilis . Peptiden har en cykliserad ryggrad och bildar tre tvärbindningar mellan svavlarna i Cys13, Cys7 och Cys4 och alfapositionerna i Phe22, Thr28 och Phe31 .
Mikrociner som produceras av kommensala E. coli -stammar riktar in sig på och eliminerar enteriska patogener såsom Salmonella enterica genom att efterlikna de sideroforer som patogenerna använder för järnrening. Mikrociner hjälper också kommensala stammar av E. coli att konkurrera ut patogena stammar.
BACTIBASE databas är en öppen databas för bakteriociner inklusive mikrociner.