Whalefall-1 RNA-motiv
| Whalefall-1 RNA-motiv | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för Whalefall-1 RNA-
| |
| identifierare | |
| Symbol | wf-1 |
| Rfam | RF01762 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | sRNA |
| Domän(er) | Metagenom för valfall |
| PDB- strukturer | PDBe |
Whalefall -1 RNA-motivet (även kallat wf-1 ) hänvisar till en konserverad RNA- struktur som upptäcktes med hjälp av bioinformatik . Strukturellt består motivet av två stamslingor (se diagram), varav den andra ofta avslutas av en CUUG- tetraloop , som är en energimässigt gynnsam RNA-sekvens. Whalefall-1 RNA finns endast i DNA extraherat från odlade bakterier som hittats vid valfall, dvs en valkadaver . Från och med 2010 har Whalefall-1 RNA inte detekterats i några kända, odlade bakteriearter och är således ett av flera RNA som finns i miljöprover .
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (mars 2010). "Jämförande genomik avslöjar 104 kandidatstrukturerade RNA från bakterier, arkéer och deras metagenomer" . Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
- ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (december 2009). "Exceptionella strukturerade icke-kodande RNA avslöjade genom bakteriell metagenomanalys" . Naturen . 462 (7273): 656–9. doi : 10.1038/nature08586 . PMC 4140389 . PMID 19956260 .
externa länkar