Vävnadsmikroarray
Vävnadsmikroarrayer (även TMA ) består av paraffinblock i vilka upp till 1000 separata vävnadskärnor är sammansatta på ett array-sätt för att möjliggöra multiplex histologisk analys .
Historia
De största begränsningarna i molekylär klinisk analys av vävnader inkluderar den besvärliga karaktären av procedurer, begränsad tillgänglighet av diagnostiska reagenser och begränsad patientprovstorlek. Tekniken med vävnadsmikroarray utvecklades för att ta itu med dessa problem.
Multivävnadsblock introducerades först av H. Battifora 1986 med hans så kallade "multitumor (korv) vävnadsblock" och modifierades 1990 med dess förbättring, "the schackbrädesvävnadsblock". 1998 utvecklade J. Kononen och medarbetare den nuvarande tekniken, som använder en ny provtagningsmetod för att producera vävnader av normal storlek och form som kan vara tätare och mer precist arrangerade.
Procedur
I vävnadsmikroarraytekniken används en ihålig nål för att avlägsna vävnadskärnor så små som 0,6 mm i diameter från områden av intresse i paraffininbäddade vävnader såsom kliniska biopsier eller tumörprover . Dessa vävnadskärnor sätts sedan in i ett mottagande paraffinblock i ett exakt åtskilt mönster. Sektioner från detta block skärs med hjälp av en mikrotom , monteras på ett objektglas och analyseras sedan med vilken metod som helst för histologisk standardanalys. Varje mikroarrayblock kan skäras i 100 – 500 sektioner, som kan utsättas för oberoende tester. Tester som vanligtvis används i vävnadsmikroarray inkluderar immunhistokemi och fluorescerande in situ hybridisering . Vävnadsmikroarrayer är särskilt användbara vid analys av cancerprover .
En variant är en Frozen tissue array .
Använd i forskning
Användningen av vävnadsmikroarrayer i kombination med immunhistokemi har varit en föredragen metod för att studera och validera cancerbiomarkörer i olika definierade cancerpatientkohorter . Möjligheten att sammanställa ett stort antal representativa cancerprover från en definierad patientkohort som också har en motsvarande klinisk databas, ger en kraftfull resurs för att studera hur olika proteinuttrycksmönster korrelerar med olika kliniska parametrar. Eftersom patientprover är sammansatta i samma block, kan sektioner färgas med samma protokoll för att undvika experimentell variation och tekniska artefakter. Kliniska cancerpatientkohorter och motsvarande vävnadsmikroarrayuppsättningar har använts för att studera diagnostiska, prognostiska och behandlingsprediktiva cancerbiomarkörer i de flesta cancerformer, inklusive lung-, bröst-, kolorektal- och njurcellscancer.
Immunhistokemi kombinerat med vävnadsmikroarrayer har också använts med framgång i storskaliga ansträngningar för att skapa en karta över proteinuttryck i en mer global skala.
Se även
- Battifora H: Multitumörvävnadsblocket (korv): ny metod för immunhistokemisk antikroppstestning. Lab Invest 1986, 55:244-248.
- Battifora H, Mehta P: Det rutiga vävnadsblocket. Ett förbättrat kontrollblock för flera vävnader. Lab Invest 1990, 63:722-724.
- Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Nat Med 1998, 4:844-847.
externa länkar
-
Media relaterade till Tissue microarray på Wikimedia Commons - National Cancer Institute Tissue Array Research Program
