URA3
| - | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5'-fosfatdekarboxylasidentifierare | |||||||
| Organism | |||||||
| Symbol | URA3 | ||||||
| Alt. symboler | YEL021W, ODCase | ||||||
| Entrez | 856692 | ||||||
| HomoloGene | 136914 | ||||||
| RefSeq (mRNA) | NM_001178836 | ||||||
| RefSeq (Prot) | NP_010893 | ||||||
| UniProt | P03962 | ||||||
| Övriga uppgifter | |||||||
| EG-nummer | 4.1.1.23 | ||||||
| Kromosom | V: 0,12 - 0,12 Mb | ||||||
| |||||||
URA3 är en gen på kromosom V i Saccharomyces cerevisiae (jäst). Dess systematiska namn är YEL021W . URA3 används ofta i jästforskning som en "markörgen", det vill säga en gen för att märka kromosomer eller plasmider . URA3 kodar för Orotidin-5'-fosfatdekarboxylas (ODCase) , som är ett enzym som katalyserar en reaktion i syntesen av pyrimidinribonukleotider (en komponent i RNA ).
Använd i jästforskning
Förlust av ODCase-aktivitet leder till brist på celltillväxt om inte uracil eller uridin tillsätts till mediet. Närvaron av URA3-genen i jäst återställer ODCase-aktivitet, vilket underlättar tillväxt på media som inte kompletterats med uracil eller uridin, vilket möjliggör selektion för jäst som bär genen. Däremot, om 5-FOA (5-fluororotinsyra) tillsätts till mediet, kommer det aktiva ODCaset att omvandla 5-FOA till den toxiska föreningen (en självmordshämmare ) 5-fluorouracil som orsakar celldöd, vilket möjliggör selektion mot jästbärande genen.
Eftersom URA3 tillåter både positiv och negativ selektion har den utvecklats som en genetisk markör för DNA-transformationer och andra genetiska tekniker hos bakterier och många svamparter. Det är en av de viktigaste genetiska markörerna i genetisk modifiering av jäst . Även om URA3 är en kraftfull valbar markör, har den en hög bakgrund. Denna bakgrund beror på att celler som tar upp mutationer i URA3 också kan växa på 5-FOA. Kolonier bör verifieras med en andra analys såsom PCR för att bekräfta att den önskade stammen har skapats.
externa länkar
- "URA3-gen" . S. cerevisiae databas . 2018.