Thermocrinis jamiesonii

Thermocrinis jamiesonii
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Bakterie
Provins:	Aquificota
Klass:	Aquificia
Beställa:	Aquificales
Familj:	Aquificaceae
Släkte:	Thermocrinis
Arter:	T. jamiesonii
Binomialt namn
	Thermocrinis jamiesonii; Dodsworth et al. 2015

Thermocrinis jamiesonii är en gramnegativ bakterie som är termofil och växer vid temperaturer från 70 till 85°C. Den växer som en kemolitoautotrof eller kemolitoheterotrof, med tiosulfat som sin enda elektrondonator , och är obligatoriskt mikroaerofil . Stammen GBS1 ^T isolerades från Great Boiling Spring, Nevada, USA. ^{[ misslyckad verifiering ]}

Fysiologi

Thermocrinis jamiesonii är en kemoautotrof och kemolitoheterotrof bakterie från familjen Aquificaceae . Det kräver tiosulfat som elektrondonator. Den kan inte använda svavel eller väte som andra inom detta släkte. Denna art kan tolerera en högre NaCl-koncentration (1,17 %) än andra arter inom släktet, som inkluderar Thermocrinis albus (0,7 %), Thermocrinis minervae (0,5 %) och Thermocrinis ruber (0,5 %). T. jamiesonii är en obligat mikroaerofil , med ett tillväxtområde på 0,5-8% syre, växer optimalt vid 1-2% och kan inte växa anaerobt . Ett neutralt pH är att föredra, som sträcker sig mellan 6,50 och 7,75, med optimal tillväxt vid 7,25. Thermocrinis jamiesonii kan använda pepton , kasaminosyror och acetat som kolkällor för kemolitoheterotrofisk tillväxt. Det kan inte använda jästextrakt , glukos , format eller formamid .

Morfologi

Thermocrinis jamiesonii är en stavformad bakterie som observerades som individ eller par. Längden på celler sträcker sig från 1,4 till 2,4 µm, med en bredd som sträcker sig från 0,4 till 0,6 µm. Flagella har inte observerats genom elektronmikroskopi och motilitet har inte observerats. Emellertid hittades gener som kodar för flageller i genomet, vilket tyder på att motilitet kan uttryckas in situ . Sporer bildades inte.

Fylogeni

En fylogenetisk analys av 16S rRNA-gensekvensen visade att Thermocrinis jamiesonii är närmast besläktad med Thermocrinis ruber , inom familjen Aquificaceae . Andra släkten i familjen inkluderar Aquifex och Hydrogenobacter .

Genomisk analys

Utkastgenomet för Thermocrinis jamiesonii är 1 315 625 bp långt i 10 kontigs. Den kodar för 1 463 gener, varav 1 415 är proteinkodande, 43 tRNA-gener och ett rRNA-operon. 36 kolhydrataktiva enzymer (CAZymes) hittades, inklusive glykosidhydrolaser (GHs), vilket tyder på att T. jamiesonii kan växa på polymerer, såsom stärkelse, som Thermocrinis minervae . Ett sox -genkluster ( soxABXYZ ) var närvarande, vilket krävs för tiosulfatoxidation. Den saknar NiFe-hydrogenas ( hyaB ) och formiatdehydrogenasgener ( fdhA ), vilket indikerar att den inte kan växa med H ₂ eller format, vilket skiljer den från andra Thermocrinis- arter. Den saknar 2-oxoglutarat-ferredoxinoxidoreduktasgenen, som krävs för att rTCA-cykeln ska fixera CO ₂ men kodar för andra enzymer som finns i denna cykel. Alla gener som var väsentliga för flagellär sammansättning var närvarande. Gener som kodar för signaturlipider C _20-22 som finns i familjen Aquificaceae var närvarande.

Ekologi

Thermocrinis jamiesonii isolerades från vattenpelaren på norra sidan av Great Boiling Spring nära Gerlach , Nevada, USA. Förekomsten av Thermocrinis -arter i källvattnet uppskattades av 16S rRNA-genundersökningar till 91,5 %.

Etymologi

Thermocrinis jamiesonii fick sitt namn efter David och Sandy Jamieson som gav logistiskt stöd under provtagningsprocessen och gav forskningstillgång till många forskare till Great Boiling Spring i Nevada, USA.

externa länkar