TPP riboswitch
| TPP-riboswitch (THI-element) | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvensbevarande av TPP-
| |
| identifierare | |
| Symbol | TPP |
| Alt. Symboler | THI |
| Rfam | RF00059 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis-reg ; riboswitch |
| Domän(er) | Eukaryota ; Bakterier ; Archaea |
| GÅ | GO: 0030976 |
| SÅ | SO:0000035 |
| PDB- strukturer | PDBe 4nyc |
TPP -riboswitch , även känd som THI-elementet och Thi-box-riboswitch , är en högkonserverad sekundär RNA- struktur . Den fungerar som en riboswitch som binder tiaminpyrofosfat (TPP) direkt och modulerar genuttryck genom en mängd olika mekanismer i arkéer , bakterier och eukaryoter . TPP är den aktiva formen av tiamin ( vitamin B 1 ), ett essentiellt koenzym som syntetiseras genom koppling av pyrimidin- och tiazolgrupper i bakterier . THI-elementet är en förlängning av ett tidigare detekterat tiaminreglerande element, thi-boxen, det finns avsevärd variation i den förutsagda längden och strukturerna för de ytterligare och fakultativa stamslingorna representerade i mörkblått i det sekundära strukturdiagrammet Analys av operonstrukturer har identifierat ett stort antal nya kandidattiaminreglerade gener , mestadels transportörer, i olika prokaryota organismer. Röntgenkristallstrukturen för TPP-riboswitch- aptameren har lösts.
![Experimental 3D structure of the TPP riboswitch (PDB: 2HOJ).[9]](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/58/TPP_riboswitch_pdb-2hoj.png/69px-TPP_riboswitch_pdb-2hoj.png)
Experimentell 3D-struktur för TPP-riboswitchen ().
![Experimental 3D structure of the TPP riboswitch (PDB: 2HOJ).[9]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:TPP_riboswitch_pdb-2hoj.png)