Syntenin-1

SDCBP
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, MDA-9, ST1, SYCL, TACIP18, MDA9, syndekanbindande protein
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Syntenin-1 är ett protein som hos människor kodas av SDCBP -genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen identifierades initialt som en molekyl som länkar syndekan-medierad signalering till cytoskelettet. Synteninproteinet innehåller tandem upprepade PDZ-domäner som binder de cytoplasmatiska, C-terminala domänerna av en mängd olika transmembranproteiner. Detta protein kan också påverka cytoskelettmembranets organisation, celladhesion, proteinhandel och aktiveringen av transkriptionsfaktorer. Proteinet är primärt lokaliserat till membranassocierade adherens-övergångar och fokala adhesioner men finns även vid det endoplasmatiska retikulumet och kärnan. Alternativ splitsning resulterar i flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Interaktioner

SDCBP har visat sig interagera med:

• EFNB1 ,
• GRIK1 ,
• GRIK2 ,
• Interleukin 5 receptor alfa subenhet ,
• Merlin ,
• RAB5A ,
• SOX4 ,
• TRAF6 ,
• ULK1 . och
• ERICH2

Vidare läsning

•    Bass MD, Humphries MJ (2002). "Cytoplasmatiska interaktioner av syndekan-4 orkestrerar adhesionsreceptor och signalering av tillväxtfaktorreceptor" . Biochem. J . 368 (Pt 1): 1–15. doi : 10.1042/BJ20021228 . PMC 1222989 . PMID 12241528 .
•    Harrod TR, Justement LB (2003). "Utvärdering av funktionen av transmembranproteintyrosinfosfatas CD148 i lymfocytbiologi". Immunol. Res . 26 (1–3): 153–66. doi : 10.1385/IR:26:1-3:153 . PMID 12403354 . S2CID 26502472 .
•   Sarkar D, Boukerche H, Su ZZ, Fisher PB (2005). "mda-9/syntenin: nya insikter i en ny cellsignalering och metastasassocierad gen". Pharmacol. Ther . 104 (2): 101–15. doi : 10.1016/j.pharmthera.2004.08.004 . PMID 15518882 .
•   "Brev: Psykiatrins tillstånd". N. Engl. J. Med . 292 (18): 982. 1975. doi : 10.1056/NEJM197505012921826 . PMID 1117941 .
•   Lin JJ, Jiang H, Fisher PB (1998). "Melanomdifferentieringsassocierad gen-9, mda-9, är en human gamma-interferonresponsiv gen". Gene . 207 (2): 105–10. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00562-3 . PMID 9511750 .
•    Torres R, Firestein BL, Dong H, Staudinger J, Olson EN, Huganir RL, Bredt DS, Gale NW, Yancopoulos GD (1999). "PDZ-proteiner binder, klusterar och samlokaliserar synaptiskt med Eph-receptorer och deras efrinligander" . Neuron . 21 (6): 1453–63. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80663-7 . PMID 9883737 . S2CID 15441813 .
•   Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (1999). "Karboxylterminalen av B klass efriner utgör ett PDZ-domänbindande motiv" . J. Biol. Chem . 274 (6): 3726–33. doi : 10.1074/jbc.274.6.3726 . PMID 9920925 .
•   Fernández-Larrea J, Merlos-Suárez A, Ureña JM, Baselga J, Arribas J (1999). "En roll för ett PDZ-protein i den tidiga sekretoriska vägen för inriktning av proTGF-alfa till cellytan" . Mol. Cell . 3 (4): 423–33. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80470-0 . PMID 10230395 .
•   Fialka I, Steinlein P, Ahorn H, Böck G, Burbelo PD, Haberfellner M, Lottspeich F, Paiha K, Pasquali C, Huber LA (1999). "Identifiering av syntenin som ett protein i det apikala tidiga endocytiska facket i Madin-Darby hundnjurceller" . J. Biol. Chem . 274 (37): 26233–9. doi : 10.1074/jbc.274.37.26233 . PMID 10473577 .
•   Grootjans JJ, Reekmans G, Ceulemans H, David G (2000). "Syntenin-syndekan-bindning kräver syndekan-synteny och samarbete mellan båda PDZ-domänerna av syntenin" . J. Biol. Chem . 275 (26): 19933–41. doi : 10.1074/jbc.M002459200 . PMID 10770943 .
•   Koroll M, Rathjen FG, Volkmer H (2001). "Den neurala celligenkänningsmolekylen neurofascin interagerar med syntenin-1 men inte med syntenin-2, som båda avslöjar självassocierande aktivitet" . J. Biol. Chem . 276 (14): 10646–54. doi : 10.1074/jbc.M010647200 . PMID 11152476 .
•    Zimmermann P, Tomatis D, Rosas M, Grootjans J, Leenaerts I, Degeest G, Reekmans G, Coomans C, David G (2001). "Karakterisering av syntenin, ett syndekanbindande PDZ-protein, som en komponent av cellvidhäftningsställen och mikrofilament" . Mol. Biol. Cell . 12 (2): 339–50. doi : 10.1091/mbc.12.2.339 . PMC 30947 . PMID 11179419 .
•   Jannatipour M, Dion P, Khan S, Jindal H, Fan X, Laganière J, Chishti AH, Rouleau GA (2001). "Schwannomin isoform-1 interagerar med syntenin via PDZ-domäner" . J. Biol. Chem . 276 (35): 33093–100. doi : 10.1074/jbc.M105792200 . PMID 11432873 .
•    Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (2001). "Cytokinspecifik transkriptionsreglering genom ett IL-5Ralpha-interagerande protein". Vetenskap . 293 (5532): 1136–8. doi : 10.1126/science.1059157 . PMID 11498591 . S2CID 28003281 .
•    Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (2002). "PDZ-proteinerna PICK1, GRIP och syntenin binder flera glutamatreceptorsubtyper. Analys av PDZ-bindande motiv" ( PDF) . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. doi : 10.1074/jbc.C200112200 . PMID 11891216 . S2CID 13732968 .
•   Koo TH, Lee JJ, Kim EM, Kim KW, Kim HD, Lee JH (2002). "Syntenin överuttrycks och främjar cellmigration i metastaserade humana bröst- och magcancercellinjer. " Onkogen . 21 (26): 4080–8. doi : 10.1038/sj.onc.1205514 . PMID 12037664 .
•    Biederer T, Sara Y, Mozhayeva M, Atasoy D, Liu X, Kavalali ET, Südhof TC (2002). "SynCAM, en synaptisk adhesionsmolekyl som driver synapsmontering". Vetenskap . 297 (5586): 1525–31. Bibcode : 2002Sci...297.1525B . doi : 10.1126/science.1072356 . PMID 12202822 . S2CID 14529914 .