Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
SFTPD
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, COLEC7, PSP-D, SFTP4, SP-D, ytaktivt protein D
Externa ID:n
Wikidata
Tensidprotein D , även känt som SP-D , är ett lungsurfaktantprotein som ingår i den kollagena familjen av proteiner som kallas collectin . Hos människor kodas SP-D av SFTPD - genen och är en del av det medfödda immunsystemet . Varje SP-D-subenhet är sammansatt av en N-terminal domän, en kollagen region , en kärnbildande halsregion och en C-terminal lektindomän. Tre av dessa subenheter sätts samman för att bilda en homotrimer, som ytterligare sammanfogas till ett tetramert komplex.
Interaktioner
Surfaktant protein D har visats interagera med DMBT1 och hemagglutinin från influensa A-virus . Posttranslationell modifiering av SP-D, dvs. S-nitrosylering byter funktion.
Se även
Vidare läsning
Atochina-Vasserman EN, Beers MF, Kadire H, Tomer Y, Inch A, Scott P, et al. (december 2007). "Selektiv hämning av inducerbar NO-syntasaktivitet in vivo vänder inflammatoriska abnormiteter i möss med D-brist på ytaktivt protein" . Journal of Immunology . 179 (12): 8090–7. doi : 10.4049/jimmunol.179.12.8090 . PMC 4009628 . PMID 18056350 .
Guo CJ, Atochina-Vasserman EN, Abramova E, Foley JP, Zaman A, Crouch E, et al. (november 2008). "S-nitrosylering av ytaktivt protein-D kontrollerar inflammatorisk funktion" . PLOS Biologi . 6 (11): e266. doi : 10.1371/journal.pbio.0060266 . PMC 2581630 . PMID 19007302 .
Hansen S, Holmskov U (augusti 1998). "Strukturella aspekter av kollektiner och receptorer för kollektiner". Immunobiologi . 199 (2): 165–89. doi : 10.1016/s0171-2985(98)80025-9 . PMID 9777404 .
Lu J, Willis AC, Reid KB (juni 1992). "Rening, karakterisering och cDNA-kloning av humant lungsurfaktant protein D" . The Biochemical Journal . 284. 284 ( Pt 3) (3): 795–802. doi : 10.1042/bj2840795 . PMC 1132609 . PMID 1339284 .
Ogasawara Y, Kuroki Y, Akino T (oktober 1992). "Pulmonellt ytaktivt protein D binder specifikt till fosfatidylinositol" . Journal of Biological Chemistry . 267 (29): 21244–9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)36824-3 . PMID 1400434 .
Rust K, Grosso L, Zhang V, Chang D, Persson A, Longmore W, et al. (oktober 1991). "Humant ytaktivt protein D: SP-D innehåller en domän för igenkänning av lektinkolhydrater av C-typ". Arkiv för biokemi och biofysik . 290 (1): 116–26. doi : 10.1016/0003-9861(91)90597-C . PMID 1898081 .
Kuroki Y, Shiratori M, Ogasawara Y, Tsuzuki A, Akino T (november 1991). "Karakterisering av pulmonellt ytaktivt protein D: dess samrening med lipider". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Lipider och lipidmetabolism . 1086 (2): 185–90. doi : 10.1016/0005-2760(91)90006-4 . PMID 1932100 .
Schaeffer E, Guillou F, Del D, Zakin MM (november 1993). "En annan kombination av transkriptionsfaktorer modulerar uttrycket av den humana transferrinpromotorn i lever- och Sertoliceller" . Journal of Biological Chemistry . 268 (31): 23399–408. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49476-3 . PMID 8226864 .
Kölble K, Lu J, Mole SE, Kaluz S, Reid KB (augusti 1993). "Tilldelning av den humana pulmonella ytaktiva protein D-genen (SFTP4) till 10q22-q23 nära det ytaktiva protein A-genklustret". Genomik . 17 (2): 294–8. doi : 10.1006/geno.1993.1324 . PMID 8406480 .
Crouch, E.; Rust, K.; Veile, R.; Donis-Keller, H .; Grosso, L. (februari 1993). "Genomisk organisation av humant ytaktivt protein D (SP-D). SP-D kodas på kromosom 10q22.2-23.1" . Journal of Biological Chemistry . 268 (4): 2976–2983. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53869-2 . PMID 8428971 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (september 1996). "Normalisering och subtraktion: två tillvägagångssätt för att underlätta genupptäckt" . Genomforskning . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C, et al. (maj 1997). "Isolering och karakterisering av en ny medlem av scavengerreceptorsuperfamiljen, glykoprotein-340 (gp-340), som en lungsurfaktant protein-D-bindande molekyl" . Journal of Biological Chemistry . 272 (21): 13743–9. doi : 10.1074/jbc.272.21.13743 . PMID 9153228 .
Botas C, Poulain F, Akiyama J, Brown C, Allen L, Goerke J, et al. (september 1998). "Förändrad surfaktant homeostas och alveolär typ II cellmorfologi hos möss som saknar surfaktant protein D" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (20): 11869–74. Bibcode : 1998PNAS...9511869B . doi : 10.1073/pnas.95.20.11869 . PMC 21732 . PMID 9751757 .
Håkansson K, Lim NK, Hoppe HJ, Reid KB (mars 1999). "Kristallstrukturen av den trimera alfa-spiralformade spiralformade spiralen och de tre lektindomänerna av humant lungsurfaktantprotein D" . Struktur . 7 (3): 255–64. doi : 10.1016/S0969-2126(99)80036-7 . PMID 10368295 .
Holmskov U, Mollenhauer J, Madsen J, Vitved L, Gronlund J, Tornoe I, et al. (september 1999). "Klonning av gp-340, en förmodad opsoninreceptor för lungsurfaktantprotein D" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (19): 10794–9. Bibcode : 1999PNAS...9610794H . doi : 10.1073/pnas.96.19.10794 . PMC 17962 . PMID 10485905 .
Lausen M, Lynch N, Schlosser A, Tornoe I, Saekmose SG, Teisner B, et al. (november 1999). "Mikrofibrilassocierat protein 4 är närvarande i lungtvätt och binder till kollagenregionen av lungsurfaktant protein D" . Journal of Biological Chemistry . 274 (45): 32234–40. doi : 10.1074/jbc.274.45.32234 . PMID 10542261 .
Madsen J, Kliem A, Tornoe I, Skjodt K, Koch C, Holmskov U (juni 2000). "Lokalisering av lungsurfaktant protein D på slemhinneytor i mänskliga vävnader" . Journal of Immunology . 164 (11): 5866–70. doi : 10.4049/jimmunol.164.11.5866 . PMID 10820266 .
Zhang L, Ikegami M, Crouch EC, Korfhagen TR, Whitsett JA (juni 2001). "Aktiviteten hos pulmonellt ytaktivt protein-D (SP-D) in vivo är beroende av oligomer struktur" . Journal of Biological Chemistry . 276 (22): 19214–9. doi : 10.1074/jbc.M010191200 . PMID 11278637 .
externa länkar
PDB galleri
1b08 : LUNGA YTAKTIVA PROTEIN D (SP-D) (FRAGMENT)
1m7l : Lösningsstruktur för coiled-coil-trimeriseringsdomänen från Lung Surfactant Protein D
1pw9 : Högupplöst kristallstruktur av ett aktivt rekombinant fragment av humant lungsurfaktant protein D
1pwb : Högupplöst kristallstruktur av ett aktivt rekombinant fragment av humant lungsurfaktant protein D med maltos
2ggu : kristallstruktur av den trimera halsen och kolhydratigenkänningsdomänen av humant ytaktivt protein D i komplex med maltotrios
2ggx : Kristallstruktur av trimerhalsen och kolhydratigenkänningsdomän av humant ytaktivt protein D i komplex med p-nitrofenylmaltosid
2orj : kristallstrukturen av den trimera halsen och kolhydratigenkänningsdomänen av humant ytaktivt protein D i komplex med N-acetylmannosamin
2ork : kristallstruktur av den trimera halsen och kolhydratigenkänningsdomänen av humant ytaktivt protein D i komplex med inositol-1-fosfat
2os9 : kristallstruktur av den trimera halsen och kolhydratigenkänningsdomänen av humant ytaktivt protein D i komplex med myoinositol