Snakehead rhabdovirus

Snakehead novirhabdovirus
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Negarnaviricota
Klass:	Monjiviricetes
Beställa:	Mononegavirales
Familj:	Rhabdoviridae
Släkte:	Novirhabdovirus
Arter:	Snakehead novirhabdovirus

Snakehead rhabdovirus (SHRV) är ett novirhabdovirus som påverkar vilda och dammodlade fiskar i varmt vatten av olika arter i Sydostasien , inklusive ormhuvud som det är uppkallat efter.

Isolering

Undersökningar genomfördes på 1970- och 1980-talen för att söka efter smittämnen som orsakar eller bidrar till en allvarlig ulcerös sjukdom, känd som epizootiskt ulcerativt syndrom (EUS), som orsakar hög dödlighet bland en mängd olika fiskarter i Asien och Stillahavsområdet . SNRV isolerades av virologen W. Wattanavijarn från en ormhuvudmurrel, Channa striata (tidigare Ophicepahalus striatus ), en art av ormhuvudfisk , som uppvisade tecken på epizootiskt ulcerativt syndrom efter ett utbrott av detta syndrom i Thailand . Det nya virala isolatet identifierades som ett rhabdovirus baserat på bilder och mätningar tagna via transmissionselektronmikroskopi och biokemiska testresultat. Plackneutralisationstester och immunfluorescenstest visade att det nya isolatet inte var serologiskt relaterat till flera andra fisk-rhabdovirus, inklusive anquilla rhabdovirus (EVX), infektiöst hematopoietisk nekrosvirus (IHNV), gädsyngel rhabdovirus (PFRV), vårviremi av karpvirus (SVCV) virus och viralt hemorragiskt septikemivirus (VHSV). Efterföljande infektionsstudier som exponerade friska ormhuvuden från en mottaglig population för SHNV utvecklade inte kliniska tecken associerade med EUS, vilket tyder på att SHRV inte spelar en signifikant roll i EUS.

Taxonomi

Det klassificeras som ett novirhabdovirus eftersom det har en nonvirion-gen (NV), vilket är det utmärkande kännetecknet för detta släkte. NV-genen är belägen mellan glykoprotein (G) och polymeras (L) gener, och innehåller en enda öppen läsram (ORF), som är 335 nukleotider lång. Den kallas "nonvirion"-genen eftersom inget motsvarande protein finns i virionet . Även om NV-generna för novirhabdovirus är liknande i storlek, inklusive cirka 110-122 kodoner , är liten sekvenshomologi uppenbar.

Kodande sekvenser för dess glykoprotein (G) gener visade sig likna de tre andra för närvarande klassificerade novirhabdovirusen, VHSV, IHNV och Hirame rhabdovirus (HIRRV), med mellan 36 % och 47 % aminosyraidentitet.

Strukturera

SHRV är ett hölje, kulformat RNA-virus som mäter cirka 170 nm x 60 nm med en elektrontät nukleokapsid.

Genom

SHRV- genomet är ett icke-segmenterat, negativt sens RNA-genom som är ungefär 11 550 nukleotider långt, med sex ORF:er, inklusive matrix (M) genen, nonvirion (NV) genen, nukleoprotein ( N) genen, fosfoproteinet ( P)-genen, polymerasgenen (stort protein, L) och den virala glykoproteingenen (G), arrangerade i följande ordning: 3'-NPMG-NV-L-5'.

Replikering

Virusreplikation sker vid både 15 °C och 28 °C i cellinje som härrör från ormhuvud och karp , även om det optimala temperaturintervallet för virusreplikation är mellan 28 °C och 31 °C.

Stabilitet

SHRV har visats bli inaktiverat efter behandling med syra (pH = 3), kloroform (50%) och värme (56 °C). SHRV i destillerat vatten kan inaktiveras helt genom mindre än fem minuters exponering för 12,5 ppm klor , 50 ppm jod eller en 1:2000 utspädning av persyredesinfektionsmedel .

Exponering av infektiösa virioner i cellodlingsmaterial för 2 % formalin minskade smittsamheten med 99,9 % efter 5 minuter och helt efter 30 minuter. Men exponering av infektiöst cellodlingsmaterial för 0,025 % formalin under 60 minuter orsakade endast en försumbar minskning av smittsamheten, och mer än 50 ppm klor behövdes för att inaktivera viruset. Även i cellodlingsvätskor gjorde exponering för 500 ppm jod under 30 minuter inte minska smittsamheten. Viruset förlorar inte smittsamhet när det exponeras i cellodlingsvätskor för malakitgrönt i 6 timmar vid 5 ppm.

Experimentella infektioner

Snakehead infektioner

Infektionsstudier med SHNV gav ingen sjukdom hos exponerade friska ormhuvuden.

Zebrafiskinfektioner

De första experimentella infektionerna utförda med SHRV i zebrafisk visade att NV-genen inte spelade någon viktig roll i patogenesen av infektion . Efterföljande experimentella infektioner exponerade zebrafiskembryon, ungdomar och vuxna för SHRV genom nedsänkning och/eller intraperitoneal (IP) injektion . Medan embryon och larver var mottagliga för infektion genom nedsänkning, var vuxna zebrafiskar endast mottagliga för infektion genom IP-injektion. Histopatologi hos infekterade embryon och unga fiskar avslöjade vaskulär monocytackumulering , ansamling av cellulärt skräp i gasblåsan , nekros av hepatocyter och nekros av faryngeala epitelceller . SHRV-inducerat interferon (IFN) och ortomyxovirusresistens (Mx) genuttryck i zebrafisk i nivåer beroende på inokuleringsväg och fiskålder.