Sekvensrelaterad amplifierad polymorfism

En sekvensrelaterad amplifierad polymorfism ( SRAP ) är en molekylär teknik , utvecklad av G. Li och CF Quiros 2001, för att upptäcka genetisk variation i de öppna läsramarna (ORF) av genom från växter och besläktade organismer .

Se även

• Inkluderande sammansatt intervallkartläggning
• Mikrosatellit (genetik)
• Molekylär beräkningsidentifiering
• Molekylär markör
• RAPD
• Verktyg för sekvensprofilering

Källor

•   Kole, Chittaranjan (2007). "Molekylära markörer och genetisk kartläggning". Oljeväxter . Vol. 2 av Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants . Springer. sid. 88. ISBN 978-3540343875 .
•   Li, G.; Quiros, CF (2001). "Sekvensrelaterad amplifierad polymorfism (SRAP) Ett nytt markörsystem baserat på en enkel PCR-reaktion: dess tillämpning på kartläggning och genmärkning i Brassica". Teoretisk och tillämpad genetik . 103 (2–3): 455–461. doi : 10.1007/s001220100570 . S2CID 3362269 .

Vidare läsning

Böcker

• Kidwell, KK; Osborn, TC (1992). "Enkla förfaranden för isolering av växt-DNA". I Beckman, JS; Osborn, TC (red.). Växtgenomer: Metoder för genetisk och fysisk kartläggning . Amsterdam, Nederländerna: Kluwer Academic Publishers . s. 1–13.
• Tegelström, H. (1992). "Detektion av mitokondriella DNA-fragment". I Hoelzel, AR (red.). Molekylärgenetisk analys av populationer: ett praktiskt tillvägagångssätt . Oxford: IRL Press. s. 89–114.

Artiklar och tidskrifter

•    Broude, Natalia E.; Chandra, Abha; Smith, Cassandra L. (1997). "Differentiell visning av genomundergrupper som innehåller specifika interspersed upprepningar" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (9): 4548–4553. Bibcode : 1997PNAS...94.4548B . doi : 10.1073/pnas.94.9.4548 . PMC 20760 . PMID 9114027 .
• Brown, Allan F.; Jeffery, Elizabeth H.; Juvik, John (2007). "En polymeraskedjereaktionsbaserad länkkarta över broccoli och identifiering av kvantitativa egenskaper associerade med skördedatum och huvudvikt" ( PDF) . Journal of the American Society for Horticultural Science . 4 (132): 507–513. doi : 10.21273/JASHS.132.4.507 .
•    Dicks, J.; Anderson, M.; Cardle, L.; Cartinhour, S.; Couchman, M.; Davenport, G.; Dickson, J.; Gale, M.; Marshall, D.; May, S.; Mcwilliam, H.; O'Malia, A.; Ougham, H.; Trick, M.; Walsh, S.; Waugh, R. (2000). "UK CropNet: En samling av databaser och bioinformatikresurser för växtväxtgenomik" . Nukleinsyraforskning . 28 (1): 104–107. doi : 10.1093/nar/28.1.104 . PMC 102397 . PMID 10592194 .
• Doyle, JJ; Doyle, JL (1987). "En snabb DNA-isoleringsprocedur för små mängder färsk bladvävnad". Fytokemisk bulletin . 19 : 11–15.
• Kosambi, D. (1944). "Uppskattningen av kartavstånd från rekombinationsvärden" . Annals of Eugenics . 12 : 172–175. doi : 10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x .
•   Lander, ES; Green, P.; Abrahamson, J.; Barlow, A.; Daly, MJ; Lincoln, SE; Newburg, L. (oktober 1987). "MAPMAKER: Ett interaktivt datorpaket för att konstruera primära genetiska länkkartor över experimentella och naturliga populationer". Genomik . 1 (2): 174–181. doi : 10.1016/0888-7543(87)90010-3 . PMID 3692487 .
•    Li, Huihui; Ribaut, Jean-Marcel; Li, Zhonglai; Wang, Jiankang (2008). "Inklusive Composite Interval Mapping (ICIM) för digenisk epistas av kvantitativa egenskaper i biparentala populationer". Teoretisk och tillämpad genetik . 116 (2): 243–260. doi : 10.1007/s00122-007-0663-5 . PMID 17985112 . S2CID 21798268 .
•    Quiros, CF; Grellet, F.; Sadowski, J.; Suzuki, T.; Li, G.; Wroblewski, T. (2001). "Arabidopsis och Brassica jämförande sekvens, struktur och geninnehåll i ABI1-Rps2-Ckl kromosomsegment och relaterade regioner" . Genetik . 157 (3): 1321–1330. doi : 10.1093/genetics/157.3.1321 . PMC 1461565 . PMID 11238417 .
• Saha, Gopesh; Sarkerb, Ashutosh; Chena, Weidong; Vandemarka, George J.; Muehlbauera, Fred J. (2010). "Arvs- och kopplingskartpositioner av gener som ger resistens mot Stemphyliumblight i linser" . Crop Science . Crop Science Society of America. 50 (5): 1831–1839. doi : 10.2135/cropsci2009.12.0709 .
• Shapiro, SS; Wilk, MB (1965). "En analys av varianstest för normalitet (fullständiga prov)". Biometrika . 52 (3–4): 591–611. doi : 10.1093/biomet/52.3-4.591 .
•   Sharma, R.; Mahla, RH; Mohapatra, T.; Bhargava, CS; Shama, MM (2003). "Isolera växtgenomiskt DNA utan liguid kväve". Växtmolekylärbiologi . 21 : 43–50. doi : 10.1007/bf02773395 . S2CID 2893909 .
•   Shen, JunLing; Ni, HuiQun; Chen, XiaoYang; Huang, ShaoWei (2010). "Genetisk mångfald av Jatropha Curcas med SRAP molekylära markörer" . Journal of Zhejiang Forestry College . 27 (3): 347–353. ISSN 1000-5692 .
•   Sorkheh, K.; Shiran, B.; Kiani, S.; Amirbakhtiar, N.; Mousavi, S.; Rouhi, Vahid; Mohammady-d, Shahram; Gradziel, Thomas M.; Malysheva-Otto, Lyudmyla V.; Martínez-Gómez, Pedro (2009). "Att diskriminera förmågan hos molekylära markörer och morfologisk karaktärisering i upprättandet av genetiska relationer i odlar genotyper av mandel och besläktade svetsarter". Journal of Forestry Research . 20 (3): 183–194. doi : 10.1007/s11676-009-0036-9 . S2CID 22190347 .
•    Williams, JGK; Kubelik, AR; Livak, KJ; Rafalski, JA; Tingey, SV (1990). "DNA-polymorfismer förstärkta av godtyckliga primrar är användbara som genetiska markörer" . Nukleinsyraforskning . 18 (22): 6531–6535. doi : 10.1093/nar/18.22.6531 . PMC 332606 . PMID 1979162 .