Salinibacter ruber
Salinibacter ruber | |
---|---|
Vetenskaplig klassificering | |
Domän: | |
Provins: | |
Klass: | |
Beställa: | |
Familj: |
Salinibacteraceae
|
Släkte: |
Salinibacter
|
Arter: |
S. ruber
|
Binomialt namn | |
Salinibacter ruber Antón et al., 2002
|
Salinibacter ruber är en extremt halofil röd bakterie , som först hittades i Spanien 2002.
Livsmiljö
Salinibacter ruber hittades i saltvattenkristallisatordammar i Alicante och Mallorca , Spanien 2002 av Antón et al . Denna miljö har mycket höga saltkoncentrationer , och Salinibacter ruber i sig kan inte växa vid under 15 % saltkoncentration, med en idealisk koncentration mellan 20 och 30 %. Den har även hittats i rosa sjöar i Australien.
Denna bakterie är känd för sin halofila livsstil, en egenskap som uppvisas främst av medlemmar av Archaea . Generellt sett spelar bakterier ingen stor roll i mikrobiella samhällen av hypersaltlösningar vid eller närmar sig NaCl-mättnad. Men med upptäckten av S. ruber utmanades denna tro. Det visade sig att S. ruber utgjorde från 5 % till 25 % av den totala prokaryota gemenskapen i de spanska saltdammar.
ca:
Salinibacter ruber hittades i saltvattenkristallisatordammar i Alicante och Mallorca , Spanien 2002 av Antón et al . Denna miljö har mycket höga saltkoncentrationer , och Salinibacter ruber i sig kan inte växa vid under 15 % saltkoncentration, med en idealisk koncentration mellan 20 och 30 %. Den har även hittats i rosa sjöar i Australien.
Denna bakterie är känd för sin halofila livsstil, en egenskap som uppvisas främst av medlemmar av Archaea . Generellt sett spelar bakterier ingen stor roll i mikrobiella samhällen av hypersaltlösningar vid eller närmar sig NaCl-mättnad. Men med upptäckten av S. ruber utmanades denna tro. Det visade sig att S. ruber utgjorde från 5 % till 25 % av den totala prokaryota gemenskapen i de spanska saltdammar.
Taxonomi
Salinibacter ruber är närmast släkt med släktet Rhodothermus som är en termofil , lätt halofil bakterie. Även om den genetiskt anses vara närmast Rhodothermus-släktet, är den mest jämförbar med familjen Halobacteriaceae , på grund av likheten i proteinstruktur. Den är rödpigmenterad, rörlig , stavformad och extremt halofilisk . Typstammen är stam M31 T (= DSM 13855 T = CECT 5946 T ) .
Egenskaper
I en studie från 2015 utförd av forskare ledda av molekylärbiologen Ken McGrath vid Lake Hillier , västra Australien , visade att medan algen Dunaliella salina , som tidigare troddes skapa färgen i denna rosa sjö , fanns i endast små mängder (0,1 % av DNA- prover), medan S. ruber utgjorde 20 till 33 % av det DNA som utvanns från sjön.
Salinibacter ruber producerar ett pigment som kallas bakterioruberin , som hjälper det att fånga och använda ljus för energi i fotosyntesprocessen . Medan pigmenten i alger finns i kloroplasterna sprids bakterioruberin över hela bakteriens cell. Detta gör det mer troligt att färgen på sjön är den hos S. ruber .
Fotnoter
Vidare läsning
- Mongodin, EF (2005). "Genomet hos Salinibacter ruber: konvergens och genutbyte bland hyperhalofila bakterier och arkéer" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 102 (50): 18147–18152. Bibcode : 2005PNAS..10218147M . doi : 10.1073/pnas.0509073102 . ISSN 0027-8424 . PMC 1312414 . PMID 16330755 .
- Brochier-Armanet, Celine; Anton, Josefa; Lucio, Marianna; Peña, Arantxa; Cifuentes, Ana; Brito-Echeverría, Jocelyn; Moritz, Franco; Tziotis, Dimitrios; López, Cristina; Urdiain, Mercedes; Schmitt-Kopplin, Philippe; Rosselló-Móra, Ramon (2013). "Hög metabolomisk mikrodiversitet inom samtidigt förekommande isolat av den extremt halofila bakterien Salinibacter ruber" . PLOS ETT . 8 (5): e64701. Bibcode : 2013PLoSO...864701A . doi : 10.1371/journal.pone.0064701 . ISSN 1932-6203 . PMC 3669384 . PMID 23741374 .
- Oren, Aharon; Mana, Lili (2003). "Sockermetabolism i den extremt halofila bakterien Salinibacter ruber" . FEMS mikrobiologibrev . 223 (1): 83–87. doi : 10.1016/S0378-1097(03)00345-8 . ISSN 0378-1097 . PMID 12799004 .
- Sher, Jonathan; Elevi, Rahel; Mana, Lily; Oren, Aharon (2004). "Glycerolmetabolism i den extremt halofila bakterien Salinibacter ruber" . FEMS mikrobiologibrev . 232 (2): 211–215. doi : 10.1016/S0378-1097(04)00077-1 . ISSN 0378-1097 . PMID 15033241 .
- Pašić, Lejla; Rodriguez-Mueller, Beltran; Martin-Cuadrado, Ana-Belen; Mira, Alex; Rohwer, Skog; Rodriguez-Valera, Francisco (2009). "Metagenomiska öar av hyperhalofiler: fallet med Salinibacter ruber" . BMC Genomics . 10 (1): 570. doi : 10.1186/1471-2164-10-570 . ISSN 1471-2164 . PMC 2800850 . PMID 19951421 .