SYTL2

SYTL2
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CHR11SYT, EXO4, PPP1R151, SGA72M, SLP2, SLP2A, synaptotagmin som 2
externa ID :n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Synaptotagmin-liknande 2 , även känd som SYTL2 , är en mänsklig gen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen är ett synaptotagmin-liknande protein (SLP) som tillhör en C2-domän-innehållande proteinfamilj. SLP-homologidomänen (SHD) för detta protein har visat sig specifikt binda den GTP-bundna formen av Ras-relaterat protein Rab-27A (RAB27A), vilket tyder på en roll i vesikelhandel. Flera alternativt kryddade transkriptvarianter som kodar för distinkta isoformer har observerats.

Interaktioner

SYTL2 har visats interagera med RAB27A .

Vidare läsning

•    Nalefski EA, Falke JJ (december 1996). "C2-domänens kalciumbindande motiv: strukturell och funktionell mångfald" . Proteinvetenskap . 5 (12): 2375–90. doi : 10.1002/pro.5560051201 . PMC 2143302 . PMID 8976547 .
•   Duncan RR, Shipston MJ, Chow RH (maj 2000). "Dubbelt C2-protein. En recension". Biochimie . 82 (5): 421–6. doi : 10.1016/S0300-9084(00)00214-5 . PMID 10865129 .
•   Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (oktober 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•    Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (mars 2000). "Hagelgevärssekvensering av det mänskliga transkriptomet med ORF-uttryckta sekvenstaggar" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
•   Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (augusti 2000). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. XVIII. De fullständiga sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 7 (4): 273–81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877 .
•   Fukuda M, Mikoshiba K (mars 2001). "Synaptotagmin-liknande protein 1-3: en ny familj av C-terminal-typ tandem C2-proteiner". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 281 (5): 1226–33. doi : 10.1006/bbrc.2001.4512 . PMID 11243866 .
•   Fukuda M, Saegusa C, Mikoshiba K (maj 2001). "Nya splitsningsisoformer av synaptotagminliknande proteiner 2 och 3: identifiering av Slp-homologidomänen". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 283 (2): 513–9. doi : 10.1006/bbrc.2001.4803 . PMID 11327731 .
•   Craxton M (september 2001). "Genomisk analys av synaptotagmin-gener". Genomik . 77 (1–2): 43–9. doi : 10.1006/geno.2001.6619 . PMID 11543631 .
•   Kuroda TS, Fukuda M, Ariga H, Mikoshiba K (mars 2002). "Slp-homologidomänen för synaptotagminliknande proteiner 1-4 och Slac2 fungerar som en ny Rab27A-bindande domän" . Journal of Biological Chemistry . 277 (11): 9212–8. doi : 10.1074/jbc.M112414200 . PMID 11773082 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (december 2002). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Fukuda M (april 2003). "Slp4-a/granuphilin-a hämmar dense-core vesikelexocytos genom interaktion med den GDP-bundna formen av Rab27A i PC12-celler" . Journal of Biological Chemistry . 278 (17): 15390–6. doi : 10.1074/jbc.M213090200 . PMID 12590134 .
•    Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil ​​A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (juli 2004). "Funktionell proteomikkartläggning av en mänsklig signalväg" . Genomforskning . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktober 2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•   Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Signalsekvens och nyckelordsfälla i silico för urval av fullängds humana cDNA som kodar för sekretion eller membranproteiner från oligokapslade cDNA-bibliotek" . DNA-forskning . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
•    Yu M, Kasai K, Nagashima K, Torii S, Yokota-Hashimoto H, Okamoto K, Takeuchi T, Gomi H, Izumi T (februari 2007). "Exophilin4/Slp2-a riktar glukagongranuler till plasmamembranet genom unik Ca2+-hämmande fosfolipidbindande aktivitet i C2A-domänen" . Cellens molekylärbiologi . 18 (2): 688–96. doi : 10.1091/mbc.E06-10-0914 . PMC 1783794 . PMID 17182843 .