Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
SNRPB2
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, Msl1, U2B'', små nukleära ribonukleoproteinpolypeptid B2
Externa ID:n
Wikidata
U2 litet nukleärt ribonukleoprotein B är ett protein som hos människor kodas av SNRPB2 -genen .
Proteinet som kodas av denna gen associerar med stamloop IV av U2 litet nukleärt ribonukleoprotein (U2 snRNP) i närvaro av snRNP-A'. Det kodade proteinet kan spela en roll vid pre-mRNA- splitsning. Autoantikroppar från patienter med systemisk lupus erythematosus känner ofta igen epitoper på det kodade proteinet. Två transkriptvarianter som kodar för samma protein har hittats för denna gen.
Vidare läsning
Feeney RJ, Zieve GW (1990). "Nukleärt utbyte av U1 och U2 snRNP-specifika proteiner" . J. Cell Biol . 110 (4): 871–81. doi : 10.1083/jcb.110.4.871 . PMC 2116108 . PMID 2139037 .
Hong W, Bennett M, Xiao Y, et al. (1997). "Association av U2 snRNP med det spliceosomala komplexet E." Nucleic Acids Res . 25 (2): 354–61. doi : 10.1093/nar/25.2.354 . PMC 146436 . PMID 9016565 .
Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (1997). "Genprodukten för spinal muskelatrofisjukdom, SMN, och dess associerade protein SIP1 är i ett komplex med spliceosomala snRNP-proteiner. " Cell . 90 (6): 1013–21. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . PMID 9323129 . S2CID 10855404 .
Moraitou M, Patrinou-Georgoula M, Guialis A (1998). "Strukturella/funktionella egenskaper hos en däggdjursmultikomponentstruktur som innehåller alla större spliceosomala små nukleära ribonukleoproteinpartiklar" . Biochem. J . 332 (1): 135–44. doi : 10.1042/bj3320135 . PMC 1219461 . PMID 9576861 .
Price SR, Evans PR, Nagai K (1998). "Kristallstruktur av det spliceosomala U2B"-U2A'-proteinkomplexet bundet till ett fragment av U2 litet nukleärt RNA". Nature . 394 (6694): 645–50. Bibcode : 1998Natur.394..645P . doi : 10.92348/10.10348 . PMID 9716128. S2CID 204999419 . _
Neubauer G, King A, Rappsilber J, et al. (1998). "Masspektrometri och EST-databassökning möjliggör karakterisering av multi-protein spliceosomkomplexet". Nat. Genet . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
Bühler D, Raker V, Lührmann R, Fischer U (2000). "Väsentlig roll för tudordomänen av SMN i spliceosomal U snRNP-montering: implikationer för spinal muskelatrofi" . Brum. Mol. Genet . 8 (13): 2351–7. doi : 10.1093/hmg/8.13.2351 . PMID 10556282 .
Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, et al. (2001). "En funktionell interaktion mellan överlevnadsmotorneuronkomplexet och RNA-polymeras II" . J. Cell Biol . 152 (1): 75–85. doi : 10.1083/jcb.152.1.75 . PMC 2193649 . PMID 11149922 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). "DNA-sekvensen och jämförande analys av human kromosom 20" . Naturen . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
Fong YW, Zhou Q (2002). "Stimulerande effekt av splitsningsfaktorer på transkriptionell förlängning". Naturen . 414 (6866): 929–33. doi : 10.1038/414929a . PMID 11780068 . S2CID 1518837 .
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et al. (2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
Chung S, Zhou Z, Huddleston KA, et al. (2002). "Krum hals är en del av den mänskliga spliceosomen och inblandad i skarvningsprocessen". Biochim. Biophys. Acta . 1576 (3): 287–97. doi : 10.1016/S0167-4781(02)00368-8 . PMID 12084575 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
PDB-galleri
1a9n : KRISTALSTRUKTUR HOS DET SPLICEOSOMAL U2B''-U2A' PROTEINKOMPLEXET BUNDET TILL ETT FRAGMENT AV U2 LITT KÄRN-RNA