SF3B14

SF3B6
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, splitsningsfaktor 3b underenhet 6
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Splicing factor 3B, 14 kDa subenhet, även känd som SF3B14 , är en human gen .

Fungera

Denna gen kodar för en 14 kDa proteinsubenhet av splitsningsfaktor 3b-komplexet. Splitsningsfaktor 3b associerar med både U2 och U11/U12 små nukleära ribonukleoproteinkomplex (U2 snRNP) av spliceosomer. Detta 14 kDa-protein interagerar direkt med subenhet 1 i splitsningsfaktor 3b-komplexet. Detta 14 kDa-protein interagerar också direkt med adenosinet som utför det första transesterifieringssteget av splitsning vid pre-mRNA-grenstället.

Interaktioner

SF3B14 har visats interagera med SF3B1 .

Vidare läsning

•    Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000). "Identifiering av nya mänskliga gener evolutionärt konserverade i Caenorhabditis elegans genom jämförande proteomik" . Genome Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
•    Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). "Genuttrycksprofilering i den mänskliga hypotalamus-hypofys-binjureaxeln och cDNA-kloning i full längd" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
•    Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). "Kloning och funktionell analys av cDNA med öppna läsramar för 300 tidigare odefinierade gener uttryckta i CD34+ hematopoetiska stam-/faderceller" . Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
•    Harrington JJ, Shelf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, ​​Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Skapande av genomomfattande proteinuttrycksbibliotek med slumpmässig aktivering av genuttryck". Nat. Biotechnol . 19 (5): 440–5. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013 . S2CID 25064683 .
•    Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (2001). "Ett nytt U2- och U11/U12-snRNP-protein som associerar med pre-mRNA-grenstället" . EMBO J . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
•    Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (2002). "Karakterisering av nya SF3b- och 17S U2 snRNP-proteiner, inklusive en human Prp5p-homolog och ett SF3b DEAD-box-protein" . EMBO J . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
•    Golas MM, Sander B, Will CL, Lührmann R, Stark H (2003). "Molekylär arkitektur för multiprotein splitsningsfaktorn SF3b". Vetenskap . 300 (5621): 980–4. Bibcode : 2003Sci...300..980G . doi : 10.1126/science.1084155 . PMID 12738865 . S2CID 31046270 .
•    Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). "Den mänskliga 18S U11/U12 snRNP innehåller en uppsättning nya proteiner som inte finns i den U2-beroende spliceosomen" . RNA . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .