SAP30

SAP30
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, Sin3A-associerat protein 30
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Sin3A-associerat protein, 30kDa , även känt som SAP30 , är ​​ett protein som hos människor kodas av SAP30- genen .

Fungera

Histonacetylering spelar en nyckelroll i regleringen av eukaryot genuttryck . Histonacetylering och deacetylering katalyseras av multisubunit-komplex. Proteinet som kodas av denna gen är en komponent i histon-deacetylaskomplexet , vilket inkluderar SIN3A , SAP18 , HDAC1 , HDAC2 , RbAp46 , RbAp48 och andra polypeptider. Detta komplex är aktivt vid deacetylering av kärnhistonoktamerer, men inaktivt vid deacetylering av nukleosomala histoner. En pseudogen av denna gen finns på kromosom 3.

Däggdjur har en paralog av SAP30, benämnd SAP30-liknande (SAP30L), som delar 70 % sekvensidentitet med SAP30. SAP30 och SAP30L utgör tillsammans en välkonserverad SAP30-proteinfamilj. Även SAP30L interagerar med flera komponenter i Sin3A-corepressorkomplexet och inducerar transkriptionsrepression via rekrytering av Sin3A och histondeacetylaser.

Proteiner från SAP30-familjen (SAP30-proteiner) har en funktionell nukleolär lokaliseringssignal och de kan rikta Sin3A till kärnan. SAP30-proteiner har sekvensoberoende kontakt med DNA genom sin N-terminala zinkberoende modul och deras sura centrala region bidrar till histon- och nukleosominteraktioner. DNA-bindningen av SAP30-proteiner regleras av de nukleära signaleringslipiderna, fosfoinositider (PI). SAP30-proteiner ger det första exemplet där DNA och PI:er verkar stå i ett ömsesidigt antagonerande inbördes förhållande när det gäller deras interaktion med zinkfingerproteiner och exemplifierar därmed den molekylära mekanismen hur dessa lipider kan bidra till genreglering.

Interaktioner

SAP30 har visat sig interagera med:

• HDAC1 ,
• Histon deacetylas 2 ,
• ING1 och
• Nukleär receptor co-repressor 1 ,
• RBBP4 ,
• RBBP7 ,
• SIN3A , och
• YY1 .

Vidare läsning

•    Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (mars 1995). "Mad-Max transkriptionell repression förmedlas av ternär komplexbildning med däggdjurshomologer av jästrepressor Sin3" . Cell . 80 (5): 767–76. doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . PMID 7889570 . S2CID 8749951 .
•   Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (maj 1997). "Histoneacetylaser och SAP18, en ny polypeptid, är komponenter i ett humant Sin3-komplex" . Cell . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . PMID 9150135 .
•   Zhang Y, Sun ZW, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Hampsey M, Reinberg D (juni 1998). "SAP30, ett nytt protein som konserveras mellan människa och jäst, är en komponent i ett histon-deacetylaskomplex" . Molekylär cell . 1 (7): 1021–31. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . PMID 9651585 .
•   Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (juli 1998). "SAP30, en komponent av mSin3-corepressorkomplexet involverad i N-CoR-medierad repression av specifika transkriptionsfaktorer" . Molekylär cell . 2 (1): 33–42. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . PMID 9702189 .
•    Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (oktober 1998). "Det dermatomyosit-specifika autoantigenet Mi2 är en komponent i ett komplex som innehåller histon-deacetylas och nukleosomombyggnadsaktiviteter. " Cell . 95 (2): 279–89. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534 . S2CID 18786866 .
•    Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (oktober 1998). "Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex". Naturen . 395 (6705): 917–21. Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427 . S2CID 4355885 .
•    Hsieh JJ, Zhou S, Chen L, Young DB, Hayward SD (januari 1999). "CIR, en corepressor som länkar DNA-bindningsfaktorn CBF1 till histon-deacetylaskomplexet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (1): 23–8. Bibcode : 1999PNAS...96...23H . doi : 10.1073/pnas.96.1.23 . PMC 15086 . PMID 9874765 .
•   Boutell JM, Thomas P, Neal JW, Weston VJ, Duce J, Harper PS, Jones AL (september 1999). "Aberranta interaktioner av transkriptionella repressorproteiner med genprodukten Huntingtons sjukdom, huntingtin" . Human molekylär genetik . 8 (9): 1647–55. doi : 10.1093/hmg/8.9.1647 . PMID 10441327 .
•    Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (augusti 1999). "Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histon-deacetylas-kärnkomplex och ett samband med DNA-metylering" . Gener & utveckling . 13 (15): 1924–35. doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920 . PMID 10444591 .
•    Krithivas A, Young DB, Liao G, Greene D, Hayward SD (oktober 2000). "Humant herpesvirus 8 LANA interagerar med proteiner i mSin3-corepressorkomplexet och reglerar negativt Epstein-Barr-virusgenexpression i dubbelt infekterade PEL-celler" . Journal of Virology . 74 (20): 9637–45. doi : 10.1128/JVI.74.20.9637-9645.2000 . PMC 112396 . PMID 11000236 .
•   Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (december 2000). "Ett nytt nukleärt receptor-corepressorkomplex, N-CoR, innehåller komponenter av däggdjurs SWI/SNF-komplexet och corepressorn KAP-1" . Journal of Biological Chemistry . 275 (51): 40463–70. doi : 10.1074/jbc.M007864200 . PMID 11013263 .
•   Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (mars 2001). "Stabila histon-deacetylaskomplex kännetecknas av närvaron av SANT-domänproteiner CoREST/kiaa0071 och Mta-L1" . Journal of Biological Chemistry . 276 (9): 6817–24. doi : 10.1074/jbc.M007372200 . PMID 11102443 .
•   Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N, Li M, Choi Y, Uesugi M, Hauser CA, Gu W, Gudkov AV, Qin J (mars 2001). "Differentiell association av produkter av alternativa transkript av kandidattumörsuppressorn ING1 med mSin3/HDAC1 transkriptionell corepressorkomplex" . Journal of Biological Chemistry . 276 (12): 8734–9. doi : 10.1074/jbc.M007664200 . PMID 11118440 .
•    Yochum GS, Ayer DE (juli 2001). "Pf1, ett nytt PHD zinkfingerprotein som länkar TLE-corepressorn till mSin3A-histondeacetylaskomplexet" . Molekylär och cellulär biologi . 21 (13): 4110–8. doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . PMC 87072 . PMID 11390640 .
•    Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (februari 2002). "Roll av Sin3-histondeacetylaskomplexet i tillväxtreglering av kandidattumörsuppressorn p33(ING1)" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (3): 835–48. doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . PMC 133546 . PMID 11784859 .
•   Saito M, Ishikawa F (september 2002). "Den mCpG-bindande domänen av human MBD3 binder inte till mCpG utan interagerar med NuRD/Mi2-komponenterna HDAC1 och MTA2" . Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35434–9. doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID 12124384 .
•    Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (april 2003). "Humant Sin3-deacetylas och tritoraxrelaterat Set1/Ash2-histon H3-K4-metyltransferas binds samman selektivt av cellproliferationsfaktorn HCF-1" . Gener & utveckling . 17 (7): 896–911. doi : 10.1101/gad.252103 . PMC 196026 . PMID 12670868 .
•   Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC (juni 2003). "Modulation av YY1-aktivitet med SAP30". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 306 (1): 267–75. doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . PMID 12788099 .
•    Sironi E, Cerri A, Tomasini D, Sirchia SM, Porta G, Rossella F, Grati FR, Simoni G (april 2004). "Förlust av heterozygositet på kromosom 4q32-35 i sporadiska basalcellscancer: bevis för inblandning av p33ING2/ING1L och SAP30 gener". Journal of Cutaneous Pathology . 31 (4): 318–22. doi : 10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x . PMID 15005689 . S2CID 2520678 .