RyeE RNA
| CyaR/Rye RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av CyaR_RyeE-
| |
| identifierare | |
| Symbol | CyaR_RyeE |
| Alt. Symboler | RyeE |
| Rfam | RF00112 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
CyaR RNA (tidigare känt som RyeE RNA) icke-kodande RNA identifierades i en storskalig screening av Escherichia coli och kallades kandidat 14. De exakta 5′ och 3′ ändarna av detta RNA är osäkra. Denna gen ligger mellan yegQ och orgK i E. coli . Detta lilla RNA visade sig vara bundet av Hfq-proteinet . Detta RNA har döpts om till CyaR för (cykliskt AMP-aktiverat RNA). Det har visats att CyaR RNA fungerar som en repressor av porin OmpX. Det har också visats att cyaR -uttryck kontrolleras hårt av det cykliska AMP-receptorproteinet, CRP .
En jämförande genomik- metod kunde detektera och verifiera de ytterligare målen ptsI , sdhA och yobF .