RyeB RNA
| SdsR/RyeB RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av SdsR_RyeB-
| |
| identifierare | |
| Symbol | SdsR_RyeB |
| Rfam | RF00111 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
SdsR /RyeB RNA är ett icke-kodande RNA som identifierades i en storskalig screening av E. coli . De exakta 5′- och 3′-ändarna av detta RNA är osäkra. Detta RNA överlappar SraC/RyeA-RNA:t på den motsatta strängen, vilket tyder på att de två kan agera på ett samordnat sätt. Det transkriberas av den allmänna stressfaktorn σ s och uttrycks mest i stationär fas. SdsR/RyeB RNA interagerar med Hfq .
Det homologa sRNA:t i S. enterica visade sig reglera syntesen av huvudporin OmpD. En studie med Salmonella identifierade 20 mål av detta sRNA inklusive transkriptionsregulator, CRP, globala DNA-bindande faktorer, StpA och HupB, antibiotikatransportproteinet TolC och RtsA/B tvåkomponentsystemet (TCS), och validerade deras inlägg. -transkriptionell kontroll av SdsR/RyeB RNA.