RybB RNA
| RybB RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av RybB-
| |
| identifierare | |
| Symbol | RybB |
| Rfam | RF00110 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
RybB är ett litet icke-kodande RNA som identifierades i en storskalig screening av Escherichia coli . Funktionen av detta korta RNA har studerats med hjälp av ett transkriptomiskt tillvägagångssätt och kinetiska analyser av mål-mRNA-sönderfall in vivo . RybB identifierades som en faktor som selektivt accelererar sönderfallet av flera stora omp-mRNA vid induktion av höljestressresponsen. Detta RNA har visat sig binda till Hfq-proteinet .
I Salmonella har direkta interaktioner för RybB med följande mål verifierats experimentellt: STM2391 ( fadL ), STM1070 ( ompA ), STM2267 ( ompC ), STM1572 ( ompD ), STM0999 ( ompF ), STM1473 ( ompN 5), ( ompN 5 ) , STM1732 ( ompW ), STM0413 ( tsx ), STM0687 ( ybfM , chip ) och STM1530.
I Escherichia coli har direkta interaktioner för RybB med följande mål verifierats experimentellt: b0805 ( fiu ), b0721 ( sdhC ), b2215 ( ompC ), b1256 ( ompW ), b2594 ( rluD ) och b0081 ( mraZ ).