RBM8A

RBM8A
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BOV-1A, BOV-1B, BOV-1C, C1DELq21.1, DEL1q21.1, MDS014, RBM8, RBM8B, TAR, Y14, ZNRP, ZRNP1, RNA-bindande motivprotein 8A Externa ID:
n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

RNA-bindande protein 8A är ett protein som hos människor kodas av RBM8A -genen .

Denna gen kodar för ett protein med ett konserverat RNA-bindande motiv. Proteinet finns övervägande i kärnan, även om det också finns i cytoplasman. Det är företrädesvis associerat med mRNA som produceras genom splitsning, inklusive både nukleära mRNA och nyligen exporterade cytoplasmatiska mRNA. Man tror att proteinet förblir associerat med splitsade mRNA som en tagg för att indikera var introner hade funnits, vilket således kopplar pre- och post-mRNA splitsningshändelser. Tidigare trodde man att två gener kodar för detta protein, RBM8A och RBM8B; man tror nu att RBM8B-lokuset är en pseudogen. Två alternativa startkodon resulterar i två former av proteinet, och denna gen använder också flera polyadenyleringsställen.

Interaktioner

RBM8A har visats interagera med IPO13 , MAGOH och UPF3A .

Relaterade genproblem

• TAR-syndrom
• 1q21.1 deletionssyndrom
• 1q21.1 duplikationssyndrom

Vidare läsning

•   Wilson KF, Fortes P, Singh US, et al. (1999). "Det nukleära cap-bindande komplexet är ett nytt mål för tillväxtfaktorreceptorkopplad signaltransduktion" . J. Biol. Chem . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID 9933612 .
•   Zhao XF, Nowak NJ, Shows TB, Aplan PD (2000). "MAGOH interagerar med ett nytt RNA-bindande protein". Genomik . 63 (1): 145–8. doi : 10.1006/geno.1999.6064 . PMID 10662555 .
•   Kataoka N, Yong J, Kim VN, et al. (2000). "Pre-mRNA splitsning avtrycker mRNA i kärnan med ett nytt RNA-bindande protein som kvarstår i cytoplasman. " Mol. Cell . 6 (3): 673–82. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00065-4 . PMID 11030346 .
•    Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Klonning och funktionell analys av cDNA med öppna läsramar för 300 tidigare odefinierade gener uttryckta i CD34+ hematopoetiska stam-/föräldrarceller" . Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
•    Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2001). "Spliceosomen deponerar flera proteiner 20–24 nukleotider uppströms om mRNA exon-exon-övergångar. " EMBO J . 19 (24): 6860–9. doi : 10.1093/emboj/19.24.6860 . PMC 305905 . PMID 11118221 .
•    Mingot JM, Kostka S, Kraft R, et al. (2001). "Importin 13: en ny förmedlare av kärnkraftsimport och -export" . EMBO J . 20 (14): 3685–94. doi : 10.1093/emboj/20.14.3685 . PMC 125545 . PMID 11447110 .
•    Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (2001). "Roll för den nonsens-medierade sönderfallsfaktorn hUpf3 i det splitsningsberoende exon-exon-övergångskomplexet". Vetenskap . 293 (5536): 1832–6. Bibcode : 2001Sci...293.1832K . doi : 10.1126/science.1062829 . PMID 11546873 . S2CID 12018200 .
•    Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Kommunikation av positionen för exon-exon-övergångar till mRNA-övervakningsmaskineriet av proteinet RNPS1". Vetenskap . 293 (5536): 1836–9. Bibcode : 2001Sci...293.1836L . doi : 10.1126/science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .
•    Hachet O, Ephrussi A (2002). "Drosophila Y14 skjutsar till den bakre delen av oocyten och krävs för oskar-mRNA-transport" . Curr. Biol . 11 (21): 1666–74. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00508-5 . PMID 11696323 . S2CID 2373806 .
•   Faurholm B, Millar RP, Katz AA (2002). "Generna som kodar för den typ II gonadotropinfrisättande hormonreceptorn och ribonukleoproteinet RBM8A hos människor överlappar varandra i två genomiska loci". Genomik . 78 (1–2): 15–8. doi : 10.1006/geno.2001.6650 . PMID 11707068 .
•    Kataoka N, Diem MD, Kim VN, et al. (2002). "Magoh, en human homolog av Drosophila mago nashi-protein, är en komponent i det splitsningsberoende exon-exon-övergångskomplexet" . EMBO J . 20 (22): 6424–33. doi : 10.1093/emboj/20.22.6424 . PMC 125744 . PMID 11707413 .
•    Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et al. (2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
•   Okubo K, Mitani H, Naruse K, et al. (2002). "Konserverad fysisk koppling av GnRH-R och RBM8 i medaka och mänskliga genom". Biochem. Biophys. Res. Commun . 293 (1): 327–31. doi : 10.1016/S0006-291X(02)00161-4 . PMID 12054603 .
•    Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). "Exonövergångskomplexet detekteras på CBP80-bundet men inte eIF4E-bundet mRNA i däggdjursceller: dynamik i mRNP-ombyggnad" . EMBO J . 21 (13): 3536–45. doi : 10.1093/emboj/cdf345 . PMC 126094 . PMID 12093754 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Gehring NH, Neu-Yilik G, Schell T, et al. (2003). "Y14 och hUpf3b bildar ett NMD-aktiverande komplex" . Mol. Cell . 11 (4): 939–49. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00142-4 . PMID 12718880 .
•    Fribourg S, Gatfield D, Izaurralde E, Conti E (2003). "Ett nytt sätt för RBD-proteinigenkänning i Y14-Mago-komplexet". Nat. Struktur. Biol . 10 (6): 433–9. doi : 10.1038/nsb926 . PMID 12730685 . S2CID 40116577 .
•    Lau CK, Diem MD, Dreyfuss G, Van Duyne GD (2004). "Struktur av Y14-Magoh-kärnan i exonkorsningskomplexet" . Curr. Biol . 13 (11): 933–41. doi : 10.1016/S0960-9822(03)00328-2 . PMID 12781131 . S2CID 14752714 .