Qrr RNA
Kvorumreglerande RNA- | |
---|---|
identifierare | |
Symbol | Qrr |
Alt. Symboler | Qrr1–5 |
Rfam | RF00378 |
Övriga uppgifter | |
RNA -typ | sRNA |
Domän(er) | Vibrio |
PDB- strukturer | PDBe |
Qrr (Quorum regulatory RNA) är ett icke-kodande RNA som tros vara involverat i regleringen av kvorumavkänning i Vibrio -arter. Man tror att dessa RNA, styrda av ett protein , Hfq , kan förmedla destabiliseringen av de kvorumavkännande masterregulatorerna LuxR/HapR/VanT- mRNA .
Qrr fungerar som en del av en negativ återkopplingsslinga som reglerar skiftet i celltillstånd från det för lågdensitetspopulationer till det i högdensitetspopulationer. I Vibrio harveyi binder Qrr och undertrycker uttrycket av luxR mRNA-transkriptet, en masterregulator av kvorumavkännande gener. Vid högre befolkningstätheter leder ökad autoinducerkoncentration till uppsägning av qrr- transkription och därav nedtryckning av luxR .
Det finns 5 olika qrr- gener (Qrr1–5) i V. harveyi ; av dessa aktiveras qrr2, 3 och 4 av LuxR.
Vidare läsning
- Shao, Y; Bassler, BL (3 april 2014). "Quorum regulatory small RNAs undertrycker typ VI-sekretion i Vibrio cholerae" . Molekylär mikrobiologi . 92 (5): 921–930. doi : 10.1111/mmi.12599 . PMC 4038675 . PMID 24698180 .