Pristionchus pacificus
.jpg)
|
|
| Pristionchus pacificus | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Rike: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: | |
| Arter: |
Pristionchus pacificus
Sommer, Carta, Kim & Sternberg, 1996
|
Pristionchus pacificus är en art av frilevande nematoder (spolmaskar) i familjen Diplogastridae . Arten har etablerats som en satellitmodellorganism till Caenorhabditis elegans , som den delade en gemensam förfader med för 200–300 miljoner år sedan. Genomet av P. pacificus har sekvenserats fullständigt, vilket i kombination med andra verktyg för genetisk analys gör denna art till en lätthanterlig modell i laboratoriet, särskilt för studier av utvecklingsbiologi .
Mundimorfism
Liksom andra arter av Pristionchus och många andra frilevande nematoder, uppvisar P. pacificus en polyfenism i sina mundelar som gör att enskilda nematoder kan specialisera sig på olika födokällor, vilket har gjort arten till en fallstudie i fenotypisk plasticitet . Polyfenismen har två former (morfer). Den vanligaste typen, åtminstone i labbstammar av vildtyp , är den "eurystomatösa" morfen, som kan livnära sig på både bakterier och andra nematoder. Den "stenostomatösa" morfen, å andra sidan, är specialiserad för att uteslutande mata på bakterier.
Differentiering till den ena eller den andra morfen beror på en kombination av miljöförhållanden och stokasticitet . De huvudsakliga morfologiska skillnaderna kan ses i mundelarna. Den eurystomatösa morfen har en sekundär tand och en bredare munhåla. Den sekundära tanden tillåter den eurystomatösa morfen att livnära sig på andra nematodmaskar. De två matningsmorferna, som gör det möjligt för nematoderna att reagera snabbt på föränderliga miljöer, specificeras av en hormonell och genetisk kaskad under larvutvecklingen .
Själverkännande
Som en rovart som livnär sig på besläktade arter är det troligt att det finns ett selektivt tryck för själverkännande, dvs igenkännande av arter. P. pacificus livnär sig inte på arter och måste därför kunna särskilja dem från andra nematodarter. Självigenkänning är inte flimmerhår , till skillnad från igenkänning av bytesdjur.
Genomik
Pristionchus pacificus- genomet sekvenserades 2005 och 2006. Analysen av P. pacificus har gett ekologisk information om denna organism. Det fastställdes att genomet hos P. pacificus är större än det hos den allmänt studerade nematoden C. elegans , och förutspåddes att genomet hos P. pacificus innehåller mer än 26 000 proteinkodande gener.
Ekologi
Det har indikerats att Pristionchus nematoder lever i en nekromenisk förening med skarabee . "Efter att skalbaggen dör fortsätter nematoden att utvecklas och livnär sig på mikrober som växer inuti den döda skalbaggen. Samlingen av bakterier, svampar och nematoderna arbetar hand i hand för att bryta ner skalbaggens kadaver". Pristionchus är alltså en allätare som kan utnyttja bakterier, protozoer och svampar som födokällor, som alla växer på kadaver av skarabee.
externa länkar
- Se priPac1- genomsamlingen i UCSC Genome Browser .