Polycomb protein EED

EED
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HWAIT1, embryonal ektodermutveckling, COGIS
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Polycomb protein EED är ett protein som hos människor kodas av EED -genen .

Fungera

Polycomb protein EED är en medlem av Polycomb -gruppen (PcG) familjen. PcG-familjemedlemmar bildar multimera proteinkomplex, som är involverade i att upprätthålla det transkriptionella repressiva tillståndet för gener under successiva cellgenerationer. Detta protein interagerar med förstärkare av zeste 2, den cytoplasmatiska svansen av integrin β7 , immunbristvirus typ 1 (HIV-1) MA-protein och histon-deacetylasproteiner . Detta protein förmedlar repression av genaktivitet genom histon-deacetylering och kan fungera som en specifik regulator av integrinfunktion. Två transkriptvarianter som kodar för distinkta isoformer har identifierats för denna gen.

Klinisk signifikans

Hos människor har en de-novo mutation i EED rapporterats hos en individ som uppvisar symtom som liknar de för Weavers syndrom .

Interaktioner

EED har visat sig interagera med:

• EZH2 ,
• HDAC1 ,
• Histon deacetylas 2 ,
• ITGB7 ,
• PPP1R8 och
• TGS1 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : O75530 (Polycomb protein EED) på PDBe-KB .

Vidare läsning

•   Joseph AM, Kumar M, Mitra D (2005). "Nef: "nödvändig och upprätthållande faktor" vid HIV-infektion". Curr. HIV Res . 3 (1): 87–94. doi : 10.2174/1570162052773013 . PMID 15638726 .
•   Van Maele B, Debyser Z (2005). "HIV-1-integration: ett samspel mellan HIV-1-integras, cellulära och virala proteiner". AIDS Rev. 7 (1): 26–43. PMID 15875659 .
•    Jones CA, Ng J, Peterson AJ, Morgan K, Simon J, Jones RS (1998). "Drosophila esc- och E(z)-proteinerna är direkta partners i polycomb-gruppmedierad repression" . Mol. Cell. Biol . 18 (5): 2825–34. doi : 10.1128/mcb.18.5.2825 . PMC 110661 . PMID 9566901 .
•    van Lohuizen M, Tijms M, Voncken JW, Schumacher A, Magnuson T, Wientjens E (1998). "Interaktion mellan mus polycomb-grupp (Pc-G) proteiner Enx1 och Enx2 med Eed: indikation för separata Pc-G komplex" . Mol. Cell. Biol . 18 (6): 3572–9. doi : 10.1128/MCB.18.6.3572 . PMC 108938 . PMID 9584197 .
•    Sewalt RG, van der Vlag J, Gunster MJ, Hamer KM, den Blaauwen JL, Satijn DP, Hendrix T, van Driel R, Otte AP (1998). "Karakterisering av interaktioner mellan däggdjurspolykamgruppsproteinerna Enx1/EZH2 och EED antyder förekomsten av olika däggdjurspolykamgruppproteinkomplex" . Mol. Cell. Biol . 18 (6): 3586–95. doi : 10.1128/mcb.18.6.3586 . PMC 108940 . PMID 9584199 .
•    Denisenko O, Shnyreva M, Suzuki H, Bomsztyk K (1998). "Punktmutationer i WD40-domänen av Eed blockerar dess interaktion med Ezh2" . Mol. Cell. Biol . 18 (10): 5634–42. doi : 10.1128/MCB.18.10.5634 . PMC 109149 . PMID 9742080 .
•   Peytavi R, Hong SS, Gay B, d'Angeac AD, Selig L, Bénichou S, Benarous R, Boulanger P (1999). "HEED, produkten av den humana homologen av den murina eed-genen, binder till matrisproteinet av HIV-1" . J. Biol. Chem . 274 (3): 1635–45. doi : 10.1074/jbc.274.3.1635 . PMID 9880543 .
•    van der Vlag J, Otte AP (1999). "Transkriptionell repression förmedlad av det mänskliga polycomb-gruppproteinet EED involverar histondeacetylering". Nat. Genet . 23 (4): 474–8. doi : 10.1038/70602 . PMID 10581039 . S2CID 6748531 .
•    Satijn DP, Hamer KM, den Blaauwen J, Otte AP (2001). "Polycomb-gruppproteinet EED interagerar med YY1, och båda proteinerna inducerar neural vävnad i Xenopus-embryon. " Mol. Cell. Biol . 21 (4): 1360–9. doi : 10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001 . PMC 99588 . PMID 11158321 .
•    Kuzmichev A, Nishioka K, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2002). "Histonmetyltransferasaktivitet associerad med ett humant multiproteinkomplex som innehåller Zeste-proteinets Enhancer" . Genes Dev . 16 (22): 2893–905. doi : 10.1101/gad.1035902 . PMC 187479 . PMID 12435631 .
•   Jin Q, van Eynde A, Beullens M, Roy N, Thiel G, Stalmans W, Bollen M (2003). "Proteinfosfatas-1 (PP1)-regulatorn, nukleär hämmare av PP1 (NIPP1), interagerar med polycomb-gruppproteinet, embryonal ektodermutveckling (EED) och fungerar som en transkriptionsrepressor" . J. Biol. Chem . 278 (33): 30677–85. doi : 10.1074/jbc.M302273200 . PMID 12788942 .
•   Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (2003). "Olika isoformer av PRIP-interagerande protein med metyltransferasdomän/trimetylguanosinsyntas lokaliseras till cytoplasman och kärnan". Biochem. Biophys. Res. Commun . 309 (1): 44–51. doi : 10.1016/S0006-291X(03)01514-6 . PMID 12943661 .
•    Violot S, Hong SS, Rakotobe D, Petit C, Gay B, Moreau K, Billaud G, Priet S, Sire J, Schwartz O, Mouscadet JF, Boulanger P (2003). "Den mänskliga polykamgruppen EED-protein interagerar med integraset av humant immunbristvirus typ 1" . J. Virol . 77 (23): 12507–22. doi : 10.1128/JVI.77.23.12507-12522.2003 . PMC 262565 . PMID 14610174 .
•   Witte V, Laffert B, Rosorius O, Lischka P, Blume K, Galler G, Stilper A, Willbold D, D'Aloja P, Sixt M, Kolanus J, Ott M, Kolanus W, Schuler G, Baur AS (2004). "HIV-1 Nef härmar en integrinreceptorsignal som rekryterar polykamgruppsproteinet Eed till plasmamembranet" . Mol. Cell . 13 (2): 179–90. doi : 10.1016/S1097-2765(04)00004-8 . PMID 14759364 .
•   Cao R, Zhang Y (2004). "SUZ12 krävs för både histonmetyltransferasaktiviteten och tystnadsfunktionen hos EED-EZH2-komplexet" . Mol. Cell . 15 (1): 57–67. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.020 . PMID 15225548 .
•    Pasini D, Bracken AP, Jensen MR, Lazzerini Denchi E, Helin K (2004). "Suz12 är avgörande för musutveckling och för EZH2-histonmetyltransferasaktivitet" . EMBO J . 23 (20): 4061–71. doi : 10.1038/sj.emboj.7600402 . PMC 524339 . PMID 15385962 .