Peroxisomal inriktningssignal
Vid biokemisk proteininriktning är en peroxisomal målinriktningssignal (PTS) en region av det peroxisomala proteinet som receptorer känner igen och binder till. Den är ansvarig för att specificera att proteiner som innehåller detta motiv är lokaliserade till peroxisomen.
Översikt
Alla peroxisomala proteiner syntetiseras i cytoplasman och måste riktas till peroxisomen. Det första steget i denna process är bindningen av proteinet till en receptor. Receptorn leder sedan komplexet till peroxisomen. Receptorer känner igen och binder till en region av det peroxisomala proteinet som kallas en peroxisomal targeting- signal eller PTS.
Peroxisomer består av en matris omgiven av ett specifikt membran . De flesta peroxisomala matrisproteiner innehåller en kort sekvens, vanligtvis tre aminosyror vid den extrema karboxisvansen av proteinet, som fungerar som PTS. Den prototypiska sekvensen (många variationer finns) är serin - lysin - leucin (-SKL i enbokstavens aminosyrakod). Detta motiv , och dess variationer, är känt som PTS1, och receptorn kallas PTS1-receptorn.
Det visade sig att PTS1-receptorn kodas av PEX5 -genen . PEX5 importerar vikta proteiner till peroxisomen, pendlar mellan peroxisomen och cytosolen. PEX5 interagerar med ett stort antal andra proteiner, inklusive Pex8p, 10p, 12p, 13p, 14p.
Några få peroxisomala matrisproteiner har en annan och mindre konserverad sekvens vid sina aminoterminaler. Denna PTS2-signal känns igen av PTS2-receptorn , kodad av PEX7-genen.
"PEX" hänvisar till en grupp gener som identifierades som viktiga för peroxisomal syntes. De numeriska attributionerna, såsom PEX5, refererar i allmänhet till den ordning i vilken de först upptäcktes.
Ett distinkt motiv används för proteiner avsedda för det peroxisomala membranet som kallas "mPTS"-motivet, vilket är mer dåligt definierat och kan bestå av diskontinuerliga subdomäner. En av dessa är vanligtvis ett kluster av basiska aminosyror (argininer och lysiner) inom en loop av protein (dvs. mellan membranomfång) som kommer att vara vänd mot matrisen. mPTS-receptorn är produkten av PEX19 .