Peptidatlas

PeptideAtlas är en proteomikdataresurs som samlar in tandemmasspektrometridataset från hela världen, bearbetar dem med Trans-Proteomic Pipeline och gör det kombinerade resultatet fritt tillgängligt för samhället . Peptide Atlas är en av grundarna av ProteomeXchange Consortium.

Historia

Den tidigaste uppfattningen av PeptideAtlas började vid Institutet för Systembiologi i Ruedi Aebersolds forskningslabb av Eric Deutsch och Sharon Chen vid Annotated Peptide Database (APD). Konceptet utökades ytterligare med ytterligare insatser från Parag Mallick och Frank Desiere. Den första instansen för en ensemble av mänskliga experiment publicerades 2004 som Human PeptideAtlas.

Konceptet utökades ytterligare till många andra arter under åren med stor ansträngning av Nichole King, Zhi Sun, Terry Farrah och Dave Campbell.

Nuvarande status

PeptideAtlas underhålls och utvecklas fortfarande vid Institutet för Systembiologi i Robert Moritz forskningslabb, ledd av Eric Deutsch, och med betydande insatser av Zhi Sun och Dave Campbell.

Se även

externa länkar