Palladin

PALLD
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CGI-151, CGI151, MYN, PNCA1, SIH002, palladin, cytoskelettassocierat protein
Externa ID :n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Palladin är ett protein som hos människor kodas av PALLD -genen . Palladin är en komponent i aktininnehållande mikrofilament som kontrollerar cellform, vidhäftning och sammandragning.

Upptäckt

Palladin karakteriserades oberoende av två forskargrupper, först i Carol Oteys labb (2000) och sedan i Olli Carpéns labb (2001). Det är en del av myotilin-myopalladin-palladin-familjen och kan spela en viktig roll för att modulera aktincytoskelettet . Palladin, i motsats till myotilin och myopalladin , som endast uttrycks i tvärstrimmig muskel , uttrycks överallt i celler av mesenkymalt ursprung.

Palladin fick sitt namn efter den italienska renässansarkitekten Andrea Palladio , vilket återspeglar dess lokalisering till arkitektoniska delar av cellen.

Det eukaryota cytoskelettet. Palladin är en komponent i detta komplexa cellulära maskineri.

Isoformer

Hos människor verkar det som om det finns sju olika isoformer, av vilka några uppstår genom alternativ skarvning . Hos möss uppstår tre stora isoformer av palladin från en enda gen. Dessa isoformer innehåller mellan tre och fem kopior (beroende på isoformen) av en Ig-liknande domän och mellan en och två kopior av en polyprolindomän.

Fungera

Palladins exakta biologiska roll är dåligt förstådd, men den har visat sig spela en roll i cytoskelettorganisation, embryonal utveckling, cellmotilitet, ärrbildning i huden och nervcellsutveckling.

Sjukdomskoppling

Nyligen har det visats att palladin- RNA överuttrycks hos patienter med pankreatisk neoplasi , och att palladin både överuttrycks och muteras i en ärftlig form av pankreascancer . Den palladinmutation som identifieras i familjär pankreascancer kan vara unik för en enda nordamerikansk familj, eftersom samma mutation inte har hittats i några andra europeiska respektive nordamerikanska populationer i två andra genetiska studier.

Vidare har Salaria et al. har visat att palladin överuttrycks i det icke-neoplastiska stroma av pankreascancer, men endast sällan i cancercellerna i sig, vilket tyder på att palladins roll i denna sjukdom kan innebära förändringar i tumörens mikromiljö. Mer forskning krävs helt klart innan detta protein och dess roll i neoplasi kan förstås fullt ut.

Sjukdomsframkallande mutationer har också identifierats i de två andra medlemmarna av denna genfamilj. Myotilinmutationer orsakar en form av lem-gördel muskeldystrofi, och mutationer i myopalladin orsakar en ärftlig form av hjärtsjukdom ( dilaterad kardiomyopati) .

Interaktioner

PALLD har visat sig interagera med EZR .

Vidare läsning

King CM, Olive CW, Cardona RA (1975). "Aktivering av cancerframkallande arylhydroxamsyror av mänskliga vävnader". J. Natl. Cancer Inst . 55 (2): 285–7. doi : 10.1093/jnci/55.2.285 . PMID 1159819 .
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, et al. (2000). "Identifiering av nya mänskliga gener evolutionärt bevarade i Caenorhabditis elegans av jämförande proteomik" . Genome Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
Bang ML, Mudry RE, McElhinny AS, et al. (2001). "Myopalladin, ett nytt 145-Kilodalton sarkomeriskt protein med flera roller i Z-Disc- och I-Band-proteinsammansättningar" . J. Cell Biol . 153 (2): 413–27. doi : 10.1083/jcb.153.2.413 . PMC 2169455 . PMID 11309420 .
Mykkänen OM, Grönholm M, Rönty M, et al. (2002). "Karakterisering av humant palladin, ett mikrofilamentassocierat protein" . Mol. Biol. Cell . 12 (10): 3060–73. doi : 10.1091/mbc.12.10.3060 . PMC 60155 . PMID 11598191 .
Eberle MA, Pfützer R, Pogue-Geile KL, et al. (2002). "Ett nytt känslighetslokus för autosomal dominant pankreascancer kartor till kromosom 4q32-34" . Am. J. Hum. Genet . 70 (4): 1044–8. doi : 10.1086/339692 . PMC 379100 . PMID 11870593 .
Moriyama K, Bonifacino JS (2003). "Pallidin är en komponent i ett multiproteinkomplex som är involverat i biogenesen av lysosomrelaterade organeller" . Trafik . 3 (9): 666–77. doi : 10.1034/j.1600-0854.2002.30908.x . PMID 12191018 . S2CID 29888859 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Lee SY, Obata Y, Yoshida M, et al. (2003). "Immunomisk analys av mänskligt sarkom" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2651–6. Bibcode : 2003PNAS..100.2651L . doi : 10.1073/pnas.0437972100 . PMC 151395 . PMID 12601173 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Rönty M, Taivainen A, Moza M, et al. (2004). "Molekylär analys av interaktionen mellan palladin och alfa-aktinin". FEBS Lett . 566 (1–3): 30–4. doi : 10.1016/j.febslet.2004.04.006 . PMID 15147863 . S2CID 86151740 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, et al. (2005). "Generering och anteckning av DNA-sekvenserna för mänskliga kromosomer 2 och 4" . Naturen . 434 (7034): 724–31. Bibcode : 2005Natur.434..724H . doi : 10.1038/nature03466 . PMID 15815621 .
Rönty M, Taivainen A, Moza M, et al. (2005). "Involvering av palladin och alfa-aktinin i inriktning av Abl/Arg-kinasadaptern ArgBP2 till aktincytoskelettet". Exp. Cell Res . 310 (1): 88–98. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.06.026 . PMID 16125169 .
Shiffman D, Ellis SG, Rowland CM, et al. (2005). "Identifiering av fyra genvarianter associerade med hjärtinfarkt" . Am. J. Hum. Genet . 77 (4): 596–605. doi : 10.1086/491674 . PMC 1275608 . PMID 16175505 .
Boukhelifa M, Moza M, Johansson T, et al. (2006). "Det prolinrika proteinet palladin är en bindande partner för profilin" . FEBS J . 273 (1): 26–33. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.05036.x . PMID 16367745 . S2CID 21207885 .
Rönty MJ, Leivonen SK, Hinz B, et al. (2007). "Isoform-specifik reglering av det aktinorganiserande proteinet palladin under TGF-beta1-inducerad myofibroblastdifferentiering" . J. Invest. Dermatol . 126 (11): 2387–96. doi : 10.1038/sj.jid.5700427 . PMID 16794588 .
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Ett sannolikhetsbaserat tillvägagångssätt för högkapacitetsproteinfosforyleringsanalys och platslokalisering". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .

externa länkar

palladin+protein,+mänskligt vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)