POT1

POT1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CMM10, HGLM9, skydd av telomerer 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Skydd av telomerer protein 1 är ett protein som hos människor kodas av POT1 -genen .

Fungera

Denna gen är en medlem av telombinfamiljen och kodar för ett nukleärt protein som är involverat i telomerunderhållet . Specifikt fungerar detta protein som en medlem av ett multiproteinkomplex känt som shelterin , som binder till TTAGGG-upprepningarna av telomerer, reglerar telomerlängden och skyddar kromosomändar från illegitim rekombination, katastrofal kromosominstabilitet och onormal kromosomsegregation. Alternativt splitsade transkriptvarianter har beskrivits.

Frånvaron av POT1 i musembryonala fibroblaster och kycklingceller leder till en skadlig DNA-skadarespons på telomerer vilket resulterar i telomerdysfunktionsinducerade foci (TIF). POT1 krävs för telomerskydd eftersom det möjliggör telomerhämning av DNA-skada responsfaktorer. Proteinet har också en roll i regleringen av telomerasaktivitet på telomerer. In vitro-experiment med användning av human POT1 har visat att minskning av POT1-nivåer resulterar i förlängning av telomerer.

Interaktioner

POT1 har visat sig interagera med ACD och TINF2 .

Patologi

Ökat transkriptionellt uttryck av denna gen är associerat med magkarcinogenes och dess progression.
Mutationer i denna gen har också associerats med förvärvet av de maligna egenskaperna hos kronisk lymfatisk leukemi .
POT1-varianter med förlust av funktion predisponerar för familjärt melanom och gliom .

Vidare läsning

de Lange T (september 2005). "Shelterin: proteinkomplexet som formar och skyddar mänskliga telomerer" . Gener & Utveckling . 19 (18): 2100–10. doi : 10.1101/gad.1346005 . PMID 16166375 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (september 1996). "Normalisering och subtraktion: två metoder för att underlätta genupptäckt" . Genomforskning . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Loayza D, De Lange T (juni 2003). "POT1 som en terminal omvandlare för TRF1 telomerlängdkontroll". Naturen . 423 (6943): 1013–8. Bibcode : 2003Natur.423.1013L . doi : 10.1038/nature01688 . PMID 12768206 . S2CID 4370276 .
Colgin LM, Baran K, Baumann P, Cech TR, Reddel RR (maj 2003). "Human POT1 underlättar telomerförlängning av telomeras" . Aktuell biologi . 13 (11): 942–6. doi : 10.1016/S0960-9822(03)00339-7 . PMID 12781132 . S2CID 17801176 .
Loayza D, Parsons H, Donigian J, Hoke K, de Lange T (mars 2004). "DNA-bindande egenskaper hos human POT1: ett nonamer 5'-TAGGGTTAG-3' minimalt bindningsställe, sekvensspecificitet och intern bindning till multimera platser" . Journal of Biological Chemistry . 279 (13): 13241–8. doi : 10.1074/jbc.M312309200 . PMID 14715659 .
Kondo T, Oue N, Yoshida K, Mitani Y, Naka K, Nakayama H, Yasui W (januari 2004). "Uttryck av POT1 är associerat med tumörstadium och telomerlängd i magkarcinom" . Cancerforskning . 64 (2): 523–9. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-03-1196 . PMID 14744765 .
Armbruster BN, Linardic CM, Veldman T, Bansal NP, Downie DL, Counter CM (april 2004). "Räddning av en hTERT-mutant som är defekt i telomerförlängning genom fusion med hPot1" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (8): 3552–61. doi : 10.1128/MCB.24.8.3552-3561.2004 . PMC 381596 . PMID 15060173 .
Liu D, Safari A, O'Connor MS, Chan DW, Laegeler A, Qin J, Songyang Z (juli 2004). "PTOP interagerar med POT1 och reglerar dess lokalisering till telomerer". Naturens cellbiologi . 6 (7): 673–80. doi : 10.1038/ncb1142 . PMID 15181449 . S2CID 11543383 .
Ye JZ, Hockemeyer D, Krutchinsky AN, Loayza D, Hooper SM, Chait BT, de Lange T (juli 2004). "POT1-interagerande protein PIP1: en telomerlängdsregulator som rekryterar POT1 till TIN2/TRF1-komplexet" . Gener & Utveckling . 18 (14): 1649–54. doi : 10.1101/gad.1215404 . PMC 478187 . PMID 15231715 .
Lei M, Podell ER, Cech TR (december 2004). "Struktur av human POT1 bunden till telomert enkelsträngat DNA ger en modell för kromosomändskydd". Naturens strukturella & molekylära biologi . 11 (12): 1223–9. doi : 10.1038/nsmb867 . PMID 15558049 . S2CID 21018496 .
Veldman T, Etheridge KT, Counter CM (december 2004). "Förlust av hPot1-funktionen leder till telomerinstabilitet och en skärliknande fenotyp" . Aktuell biologi . 14 (24): 2264–70. doi : 10.1016/j.cub.2004.12.031 . PMID 15620654 . S2CID 18198999 .
Kelleher C, Kurth I, Lingner J (januari 2005). "Humant skydd av telomerer 1 (POT1) är en negativ regulator av telomerasaktivitet in vitro" . Molekylär och cellulär biologi . 25 (2): 808–18. doi : 10.1128/MCB.25.2.808-818.2005 . PMC 543404 . PMID 15632080 .
Yang Q, Zheng YL, Harris CC (februari 2005). "POT1 och TRF2 samarbetar för att upprätthålla telomerisk integritet" . Molekylär och cellulär biologi . 25 (3): 1070–80. doi : 10.1128/MCB.25.3.1070-1080.2005 . PMC 544002 . PMID 15657433 .
Lei M, Zaug AJ, Podell ER, Cech TR (maj 2005). "Slå på och av humant telomeras med hPOT1-protein in vitro" . Journal of Biological Chemistry . 280 (21): 20449–56. doi : 10.1074/jbc.M502212200 . PMID 15792951 .

externa länkar

PDBe-KB ger en översikt över all strukturinformation som finns tillgänglig i PDB för mänskligt skydd av telomerprotein 1 (POT1)