Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
PDE6D
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, JBTS22, PDED, fosfodiesteras 6D
Externa ID:
n EC-nummer
Wikidata
Rhodopsinkänsligt cGMP 3',5'-cykliskt fosfodiesteras underenhet delta i näthinnestaven är ett enzym som hos människor kodas av PDE6D - genen . PDE6D identifierades ursprungligen som en fjärde subenhet av stavcellsspecifikt cGMP- fosfodiesteras (PDE) ( EC 3.1.4.35 ) . Den exakta funktionen av PDE delta-subenheten i det stavspecifika GMP-PDE-komplexet är oklart. Dessutom är PDE delta-subenheten inte begränsad till fotoreceptorceller utan är brett distribuerad i olika vävnader. PDE delta-subenhet tros vara en specifik löslig transportfaktor för vissa prenylerade proteiner och Arl2-GTP en regulator av PDE-medierad transport.
Interaktioner
PDE6D har visat sig interagera med:
Vidare läsning
Marzesco AM, Galli T, Louvard D, Zahraoui A (aug 1998). "Stav cGMP fosfodiesteras delta subenhet dissocierar den lilla GTPase Rab13 från membran" . Journal of Biological Chemistry . 273 (35): 22340–5. doi : 10.1074/jbc.273.35.22340 . PMID 9712853 .
Lorenz B, Migliaccio C, Lichtner P, Meyer C, Strom TM, D'Urso M, Becker J, Ciccodicola A, Meitinger T (1998). "Kloning och genstruktur för staven cGMP fosfodiesteras delta subenhet gen (PDED) i människa och mus" . European Journal of Human Genetics . 6 (3): 283–90. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200215 . PMID 9781033 .
Linari M, Ueffing M, Manson F, Wright A, Meitinger T, Becker J (feb 1999). "Retinitis pigmentosa GTPase-regulatorn, RPGR, interagerar med delta-subenheten av stavcykliskt GMP-fosfodiesteras" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (4): 1315–20. Bibcode : 1999PNAS...96.1315L . doi : 10.1073/pnas.96.4.1315 . PMC 15460 . PMID 9990021 .
Mou H, Grazio HJ, Cook TA, Beavo JA, Cote RH (juni 1999). "cGMP-bindning till icke-katalytiska ställen på fotoreceptorfosfodiesteras från däggdjursstavar regleras genom bindning av dess gamma- och delta-subenheter" . Journal of Biological Chemistry . 274 (26): 18813–20. doi : 10.1074/jbc.274.26.18813 . PMID 10373499 .
Linari M, Hanzal-Bayer M, Becker J (sep 1999). "Delta-underenheten av stavspecifikt cykliskt GMP-fosfodiesteras, PDE delta, interagerar med det Arf-liknande proteinet Arl3 på ett GTP-specifikt sätt". FEBS Bokstäver . 458 (1): 55–9. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01117-5 . PMID 10518933 . S2CID 23460401 .
Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (april 2002). "Delta subenheten av retinal stav cGMP fosfodiesteras reglerar membranassociationen av Ras och Rap GTPaser" . Journal of Biological Chemistry . 277 (17): 15076–84. doi : 10.1074/jbc.M109983200 . PMID 11786539 .
Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (maj 2002). "Komplexet av Arl2-GTP och PDE delta: från struktur till funktion" . EMBO Journal . 21 (9): 2095–106. doi : 10.1093/emboj/21.9.2095 . PMC 125981 . PMID 11980706 .
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (sep 2005). "Ett nätverk av mänskligt protein-proteininteraktion: en resurs för att kommentera proteomet" . Cell . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
Wilson SJ, Smyth EM (april 2006). "Internalisering och återvinning av den humana prostacyklinreceptorn moduleras genom dess isoprenyleringsberoende interaktion med delta-subenheten av cGMP fosfodiesteras 6" . Journal of Biological Chemistry . 281 (17): 11780–6. doi : 10.1074/jbc.M513110200 . PMID 16527812 .
PDB galleri
1ksg : Komplex av Arl2 och PDE delta, Crystal Form 1
1ksh : Komplex av Arl2 och PDE delta, Crystal Form 2 (native)
1ksj : Komplex av Arl2 och PDE delta, Crystal Form 2 (SeMet)