PATZ1

PATZ1
Protein PATZ1 PDB 2EPP.png
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning:
Identifierare
, MAZR, PATZ, RIAZ, ZBTB19, ZNF278, ZSG, dJ400N23, POZ/BTB och AT-krok som innehåller zinkfinger 1
Externa ID :n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

POZ-, AT-krok- och zinkfingerinnehållande protein 1 är ett protein som hos människor kodas av PATZ1 -genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen innehåller ett AT-hook DNA-bindande motiv, som vanligtvis binder till andra DNA-bindande strukturer för att spela en viktig roll i kromatinmodellering och transkriptionsreglering. Dess Poz-domän tros fungera som en plats för protein-proteininteraktion och krävs för transkriptionell repression, och zinkfingrarna utgör den DNA-bindande domänen. Eftersom det kodade proteinet har typiska egenskaper för en transkriptionsfaktor, antas det vara en repressor av genuttryck. I små rundcelliga sarkom fusioneras denna gen till EWS genom en liten inversion av 22q, sedan tros hybriden vara translokerad (t(1;22)(p36.1;q12). Omarrangemanget av kromosom 22 involverar intron 8 av EWS och exon 1 av denna gen som skapar en chimär sekvens innehållande transaktiveringsdomänen av EWS fuserad till zinkfingerdomänen av detta protein. Detta är ett distinkt exempel på en intrakromosomal omarrangemang av kromosom 22. Fyra alternativt splitsade transkriptvarianter beskrivs för denna gen.

Interaktioner

PATZ1 har visat sig interagera med:

Vidare läsning