Nudix hydrolas
| NUDIX- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktur av MT-ADPRase, ett Nudix-hydrolas från Mycobacterium tuberculosis
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | NUDIX | ||||||||
| Pfam | PF00293 | ||||||||
| Pfam klan | CL0261 | ||||||||
| InterPro | IPR000086 | ||||||||
| |||||||||
| NUDIX-liknande | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstruktur av NADH-pyrofosfatas (1790429) från Escherichia coli k12 vid 2.20 a resolution
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | NUDIX-liknande | ||||||||
| Pfam | PF09296 | ||||||||
| Pfam klan | CL0261 | ||||||||
| InterPro | IPR015375 | ||||||||
| SCOP2 | 1vk6 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
NUDIX-hydrolaser är en superfamilj av hydrolytiska enzymer som kan klyva nukleosid - difosfater kopplade till x (vilken del som helst), därav deras namn. Reaktionen ger nukleosidmonofosfat (NMP) plus XP. Substrat hydrolyserade av nudix-enzymer omfattar ett brett spektrum av organiska pyrofosfater, inklusive nukleosid-di- och -trifosfater, dinukleosid- och difosfoinositolpolyfosfater, nukleotidsocker och RNA-kapslar, med olika grader av substratspecificitet. Enzymer från NUDIX-superfamiljen finns i alla typer av organismer, inklusive eukaryoter, bakterier och arkéer.
Det finns två komponenter i NUDIX-familjen: det så kallade NUDIX-vecket av ett beta-ark med alfaspiraler på varje sida och NUDIX-motivet som innehåller katalytiska och metallbindande aminosyror . Nudix-motivet är GXXXXXEXXXXXXXREUXEEXGU där U är isoleucin, leucin eller valin, och X är vilken aminosyra som helst. Detta bildar en kort helix som (vanligtvis) innehåller de katalytiska aminosyrorna. NUDIX-hydrolaser inkluderar Dcp2 av decapping-komplexet , ADP-ribos-difosfatas , MutT, ADPRase, Ap4A-hydrolaser, RppH och många andra.