Nitroreduktas
Nitroreduktasidentifierare | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
_ | |||||||||||
Symbol | Nitroreduktas | ||||||||||
Pfam | PF00881 | ||||||||||
InterPro | IPR000415 | ||||||||||
CDD | cd02062 | ||||||||||
|
Nitroreduktaser är en familj av evolutionärt besläktade proteiner involverade i reduktionen av kväveinnehållande föreningar, inklusive de som innehåller den nitrofunktionella gruppen. Medlemmar av denna familj använder flavinmononukleotid som en kofaktor och visar sig ofta vara homodimerer.
Medlemmar av denna familj inkluderar syreokänsligt NAD(P)H-nitroreduktas (flavinmononukleotidberoende nitroreduktas) ( 6,7-dihydropteridinreduktas ) ( EC 1.5.1.34 ) och NADH-dehydrogenas ( EC 1.6.99.3 ). Ett antal av dessa proteiner beskrivs som oxidoreduktaser. De finns främst i bakteriehärkomster även om ett antal eukaryota homologer har identifierats: C. elegans , D. melanogaster , , mus och människa. Detta protein finns inte i fotosyntetiska eukaryoter. Sekvenserna som innehåller denna post i fotosyntetiska organismer är möjliga falska positiva. [ citat behövs ]
Nitroreduktaset från Enterobacter cloacae identifierades av Bryant och Deluca i en stam isolerad från en ammunitionsanläggning, på grundval av dess förmåga att metabolisera TNT (trinitrotoluen). Sedan dess har många homologer identifierats och familjen är nu känd för att inkludera medlemmar i olika organismer, som katalyserar olika reaktioner. Jodtyrosindeiodenaset från däggdjur är ett dehalogenas, BluB av Sinorhizobium meliloti kannibaliserar den bundna flavinmononukleotiden för att tillhandahålla en kritisk intermediär i vitamin B12-biosyntesen .
Kristallstrukturer av enzymerna E. cloacae och E. coli har publicerats med en mängd olika substrat och analoger bundna.
Ett exempel på ett potentiellt kallaktivt enzym för prodrugterapi beskrevs med användning av ett kallaktivt nitroreduktas, Ssap-NtrB (Çelik och Yetis, 2012). Trots Ssap-NtrB härrörande från en mesofil bakterie, visade den optimal aktivitet vid 20°C mot cancerprodrugs. Författare kommenterar att kylaktiviteten hos detta nya enzym kommer att vara användbar för terapier i kombination med krymoterapi, och exponerar målvävnaden för låga temperaturer för att utlösa enzymaktiviteten för att aktivera läkemedlet endast där det behövs. Dessutom skulle enzymet också kunna användas för bioremediering av föreningar av explosiv och flyktig natur i regioner där hög aktivitet vid låga temperaturer behövs.
Underfamiljer
Humana proteiner som innehåller denna domän
IYD ;