Neuronamn
Innehåll | |
---|---|
Beskrivning | Omfattande hierarkisk nomenklatur för strukturer i primathjärnan (människa och makaker) |
Datatyper infångade |
Neuroanatomi |
Tillgång | |
Hemsida | |
Diverse | |
Licens |
Creative Commons Attribution 3.0 Unported-licens |
NeuroNames är en integrerad nomenklatur för strukturer i hjärnan och ryggmärgen hos de fyra arter som studeras mest av neuroforskare: människa , makak , råtta och mus . Den erbjuder ett standardiserat, kontrollerat ordförråd med vanliga namn på strukturer, som är lämpligt för entydig neuroanatomisk indexering av information i digitala databaser. Termer i standardvokabulären har valts ut för att underlätta uttal, minnesvärde och användningsfrekvens i nya neurovetenskapliga publikationer. Strukturer och deras relationer till varandra definieras i termer av standardvokabulär. För närvarande innehåller NeuroNames standardnamn, synonymer och definitioner av cirka 2 500 neuroanatomiska enheter.
Nomenklaturen upprätthålls av University of Washington och är kärnkomponenten i ett verktyg som kallas "BrainInfo". BrainInfo hjälper en att identifiera strukturer i hjärnan. Man kan antingen söka på ett strukturnamn eller lokalisera strukturen i en hjärnatlas och få information som dess placering i den klassiska hjärnhierarkin, bilder av strukturen, vilka celler den har, dess kopplingar och gener uttryckta där. Information kan nås av någon av cirka 16 000 synonymer på åtta språk.
NeuroNames är en källvokabulär för Metathesaurus i Unified Medical Language System . Det beskrivs ingående i följande tre vetenskapliga artiklar :
- DM Bowden & RF Martin (mars 1995). "NeuroNames hjärnhierarki". NeuroImage . 2 (1): 63–83. doi : 10.1006/nimg.1995.1009 . PMID 9410576 . S2CID 24847350 .
- DM Bowden & MF Dubach (2003). "NeuroNames 2002". Neuroinformatik . 1 (1): 43–59. doi : 10.1385/NI:1:1:043 . PMID 15055392 . S2CID 12575028 .
- DM Bowden; E. Sång; J. Kosheleva; MF Dubach (2011). "NeuroNames: An Ontology for the BrainInfo Portal to Neuroscience on the Web" . Neuroinformatik . 10 (1): 97–114. doi : 10.1007/s12021-011-9128-8 . PMC 3247656 . PMID 21789500 .
Se även
externa länkar