neuGRID
 NeuGRID logotyp
| |
| URL | |
|---|---|
| Nuvarande status | Aktiva |
neuGRID är en webbportal som syftar till att (i) hjälpa neuroforskare att göra högkapacitetsavbildningsforskning, och (ii ) tillhandahålla kliniska neurologer automatiserade diagnostiska avbildningsmarkörer för neurodegenerativa sjukdomar för individuell patientdiagnos. neuGRID:s användarvänliga miljö är anpassad för en rad användare från studenter till seniora neuroforskare som arbetar inom områdena Alzheimers sjukdom , psykiatriska sjukdomar och vita substanssjukdomar. neuGRID har som mål att bli en utbredd resurs för hjärnavbildningsanalyser.
Bearbeta
Genom den enda virtuella åtkomstpunkten Science Gateway webbportal loggar användarna in och får åtkomst till ett "virtuellt" bildlaboratorium. Här kan användare ladda upp, använda och dela algoritmer för hjärnavbildningsanalys, ha tillgång till stora neuroavbildningsdatauppsättningar och göra beräkningsintensiva analyser, hela tiden med specialiserat stöd och utbildning. Tack vare distribuerade tjänster och grid / molnberäkningsresurser är analyser med neuGRID mycket snabbare än traditionella labbbaserade analyser. neuGRIDs proof-of-concept genomfördes 2009 när en biomarkör för Alzheimers sjukdom (3D kortikal tjocklek med Freesurfer och CIVET) extraherades från 6 500 MR-skanningar på 2 veckor jämfört med 5 år som den skulle ha tagit i en traditionell miljö.
Historia
neuGRID finansierades först av EU-kommissionens DG INFSO inom det 7:e ramprogrammet från 2008 till 2011. Här utvecklades hårdvaru- och mellanvaruinfrastrukturen. Den andra vågen finansierades 2011 av Europeiska kommissionen , numera DG CONNECT, under projektet neuGRID for you (N4U), med huvudsyftet att utöka användartjänsterna med mer intuitiva och grafiska gränssnitt. N4U avslutades i april 2015.
Konsortium
Det första neuGRID-konsortiet involverade 8 europeiska partners från Italien, Frankrike, Storbritannien, Nederländerna, Sverige, Spanien och Schweiz. N4U involverade 9 europeiska partners (varav 6 redan i neuGRID) och 2 nordamerikaner. Internationella partners har varit involverade tack vare en stödåtgärd som återigen finansierats av GD INFSO ( outGRID , http://www.outgrid.eu ). Koordinator för alla tre projekten är Giovanni B Frisoni, neurolog baserad på IRCCS Fatebenefratelli, National Center for Alzheimers Disease i Brescia, Italien.
Anteckningar
Andra publikationer
Neurovetenskapliga studier där neuGRID har använts som en resurs
- Redolfi, A; Bosco, P; Manset, D; Frisoni, GB; The Neugrid Consortium (2013). "Hjärnutredning och hjärnkonceptualisering" . Funktionell neurologi . 28 (3): 175–90. PMC 3812741 . PMID 24139654 .
- Cover, Keith S.; Van Schijndel, Ronald A.; Van Dijk, Bob W.; Redolfi, Alberto; Knol, Dirk L.; Frisoni, Giovanni B.; Barkhof, Frederik; Vrenken, Hugo; NeuGRID; Alzheimers sjukdom Neuroimaging Initiative (2011). "Bedöma reproducerbarheten av SienaX och Siena hjärnatrofimätningar med ADNI rygg-mot-rygg MP-RAGE MRI-skanningar" . Psykiatriforskning: Neuroimaging . 193 (3): 182–90. doi : 10.1016/j.pscychresns.2011.02.012 . PMID 21764565 .
- Frisoni, Giovanni B.; Fox, Nick C.; Jack Jr, Clifford R.; Scheltens, Philip; Thompson, Paul M. (2010). "Den kliniska användningen av strukturell MRI vid Alzheimers sjukdom" . Naturrecensioner Neurologi . 6 (2): 67–77. doi : 10.1038/nrneurol.2009.215 . PMC 2938772 . PMID 20139996 .
- För en fullständig lista över neuGRID-publikationerna besök: https://www.neugrid2.eu/index.php/scientific-publications/