NUDT21

NUDT21
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CFIM25, CPSF5, nudix hydrolase 21
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Klyvnings- och polyadenyleringsspecificitetsfaktor subenhet 5 ( CPSF5 ) är ett enzym som hos människor kodas av NUDT21 -genen . Den tillhör Nudix-familjen av hydrolaser.

Proteinet som kodas av denna gen är en subenhet av klyvningsfaktor Im-komplexet som krävs för 3'-RNA-klyvning och polyadenyleringsbearbetning. Interaktionen mellan proteinet och RNA :t är ett av de tidigaste stegen i sammansättningen av 3'-ändens bearbetningskomplex och underlättar rekryteringen av andra bearbetningsfaktorer. Denna gen kodar för 25 kD-subenheten av proteinkomplexet, som är sammansatt av fyra polypeptider.

Vidare läsning

•   Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (1996). "Rening och karakterisering av human klyvningsfaktor Jag är involverad i 3'-ändens bearbetning av budbärar-RNA-prekursorer" . J. Biol. Chem . 271 (11): 6107–13. doi : 10.1074/jbc.271.11.6107 . PMID 8626397 .
•    de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, et al. (2000). "Human pre-mRNA-klyvningsfaktor IIm innehåller homologer av jästproteiner och överbryggar två andra klyvningsfaktorer" . EMBO J . 19 (21): 5895–904. doi : 10.1093/emboj/19.21.5895 . PMC 305781 . PMID 11060040 .
•    Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA-kloning med in vitro platsspecifik rekombination" . Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
•    Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Mot en katalog över mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande mänskliga cDNA:n" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
•    Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
•   Kim H, Lee Y (2002). "Interaktion av poly(A)-polymeras med 25-kDa-subenheten av klyvningsfaktor I". Biochem. Biophys. Res. Commun . 289 (2): 513–8. doi : 10.1006/bbrc.2001.5992 . PMID 11716503 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Awasthi S, Alwine JC (2003). "Association av polyadenyleringsklyvningsfaktor I med U1 snRNP" . RNA . 9 (11): 1400–9. doi : 10.1261/rna.5104603 . PMC 1287061 . PMID 14561889 .
•   Brown KM, Gilmartin GM (2004). "En mekanism för reglering av pre-mRNA 3'-bearbetning av human klyvningsfaktor Im" . Mol. Cell . 12 (6): 1467–76. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00453-2 . PMID 14690600 .
•    Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
•    Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, et al. (2005). "Distinkt sekvensmotiv inom 68-kDa-underenheten av klyvningsfaktor Im förmedlar RNA-bindning, protein-protein-interaktioner och subcellulär lokalisering" ( PDF) . J. Biol. Chem . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID 15169763 . S2CID 39752996 .
•    Lehner B, Sanderson CM (2004). "Ett proteininteraktionsramverk för nedbrytning av mänsklig mRNA" . Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "Från ORFeome till Biology: A Functional Genomics Pipeline" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). "Ett mänskligt protein-proteininteraktionsnätverk: en resurs för att kommentera proteomen". Cell . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•    Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "LIFEdb-databasen 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (Databasproblem): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .