MutS-1
| MutS_I | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kristallstrukturen för E. coli MutS som binder till DNA med en a:a-
| |||||||||
| felmatchningsidentifierare | |||||||||
| Symbol | MutS_I | ||||||||
| Pfam | PF01624 | ||||||||
| InterPro | IPR007695 | ||||||||
| SMART | MUTSd | ||||||||
| PROSITE | PDOC00388 | ||||||||
| SCOP2 | 1ng9 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
MutS är ett felaktigt DNA-reparationsprotein, som ursprungligen beskrevs i Escherichia coli .
Reparation av felmatchning bidrar till den övergripande tillförlitligheten av DNA-replikation och är avgörande för att bekämpa de negativa effekterna av skada på genomet . Det involverar korrigering av felaktiga baspar som har missats av korrekturläsningselementet ( Klenow-fragmentet ) i DNA - polymeraskomplexet . Det post-replikativa Mismatch Repair System (MMRS) av Escherichia coli involverar MutS (Mutator S), MutL och MutH proteiner och verkar för att korrigera punktmutationer eller små insättnings-/deletionsslingor som produceras under DNA-replikation.
MutS och MutL är involverade i att förhindra rekombination mellan delvis homologa DNA- sekvenser . Sammansättningen av MMRS initieras av MutS, som känner igen och binder till felparade nukleotider och tillåter ytterligare verkan av MutL och MutH för att eliminera en del av nysyntetiserad DNA-sträng som innehåller den felparade basen . MutS kan också samarbeta med metyltransferaser vid reparation av O(6)-metylguaninskada, som annars skulle paras ihop med tymin under replikering för att skapa en O(6)mG:T-felanpassning. MutS existerar som en dimer, där de två monomererna har olika konformationer och bildar en heterodimer på strukturell nivå. Endast en monomer känner igen missanpassningen specifikt och har ADP -bunden. Icke-specifika DNA-bindande domäner med huvudspår från båda monomererna omfattar DNA:t i en klämliknande struktur . Felpassningsbindning inducerar ATP-upptag och en konformationsförändring i MutS-proteinet, vilket resulterar i en klämma som translokerar på DNA.
MutS är ett modulärt protein med en komplex struktur och består av:
- N-terminal missmatch-igenkänningsdomän, som i struktur liknar tRNA- endonukleas .
- Anslutningsdomän, som till sin struktur liknar Holliday junction resolvase ruvC.
- Kärndomän, som är sammansatt av två separata underdomäner som går samman för att bilda en spiralformad bunt; inifrån kärndomänen fungerar två spiraler som spakar som sträcker sig mot (men inte vidrör) DNA:t.
- Clamp-domän, som sätts in mellan de två underdomänerna av kärndomänen överst på spakens spiraler; clamp-domänen har en beta- arkstruktur .
- ATPase-domän (ansluten till kärndomänen), som har ett klassiskt Walker A- motiv .
- HTH-domän (helix-turn-helix), som är involverad i dimerkontakter .
Homologer av MutS har hittats i många arter inklusive eukaryoter (MSH 1, 2, 3, 4, 5 och 6 proteiner), archaea och bakterier, och tillsammans har dessa proteiner grupperats i MutS-familjen. Även om många av dessa proteiner har liknande aktiviteter som E. coli MutS, finns det en betydande mångfald av funktion bland MutS-familjens medlemmar. Denna mångfald ses till och med inom arter, där många arter kodar för flera MutS- homologer med distinkta funktioner. Homologer mellan arter kan ha uppstått genom frekvent forntida horisontell genöverföring av MutS (och MutL) från bakterier till arkéer och eukaryoter via endosymbiotiska förfäder till mitokondrier och kloroplaster .
Denna post representerar den N-terminala domänen av proteiner i MutS-familjen av DNA-felmatchningsreparationsproteiner, såväl som närbesläktade proteiner. Den N-terminala domänen av MutS är ansvarig för igenkänning av felparning och bildar ett 6-strängat blandat beta-ark omgivet av tre alfa-helixar, vilket liknar strukturen för tRNA- endonukleas . Jäst MSH3, bakteriella proteiner involverade i DNA-felmatchningsreparation och den förutsagda proteinprodukten från Rep-3-genen från mus delar omfattande sekvenslikhet . Humant MSH har varit inblandat i icke-polypos kolorektalt karcinom (HNPCC) och är ett felparningsbindande protein.