Marinobacter hydrocarbonoclasticus
| Marinobacter hydrocarbonoclasticus | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: | |
| Binomialt namn | |
|
Marinobacter hydrocarbonoclasticus Gauthier et al. 1992
|
|
| Synonymer | |
|
|
|
Marinobacter hydrocarbonoclasticus är en bakterieart som finns i havsvatten och som kan bryta ned kolväten. Cellerna är stavformade och rörliga med hjälp av ett enda polärt flagellum .
Etymologi
"Kylväte-oklastisk" betyder "demontering av kolväten." Dessa bakterier namngavs som sådana eftersom de kan bryta ned huvudkomponenterna i olja.
Historia
Både släktet Marinobacter och arten Marinobacter hydrocarbonoclasticus identifierades och beskrevs först 1992 av Gauthier et al. Genom att använda polymeraskedjereaktion för att analysera med 16sRNA-DNA, visade Gauthier att det var en medlem av gammagruppen av Proteobacteria, med tillräckligt avstånd till andra beskrivna Proteobacteria för att motivera skapandet av ett nytt släkte.
År 2005 använde Marquez och Ventosa från institutionen för mikrobiologi och parasitologi vid University of Sevilla i Spanien "G+C-innehåll, fettsyrasammansättning och DNA-DNA-hybridisering... för att förstå de taxonomiska positionerna" hos Marinobacter hydrocarbonoclasticus och Marinobacter aquaeolei . "Marquez föreslår att de två arterna förenas under samma namn eftersom de är heterotypa synonymer på grund av fenotypiska och fylogenetiska egenskaper."
2011 upptäckte Hamdan & Fuller att Marinobacter hydrocarbonoclastus dör när de exponeras för det kemiska dispergermedlet COREXIT EC9500A som används för att behandla oljeutsläppet Deepwater Horizon .
Genomets struktur
Genomet av Marinobacter hydrocarbonoclasticus har en halt på 52,7 % guanin + cytosin.
Evolution och fylogeni
Marinobacter hydrocarbonoclasticus är en typ av eubakterier. 16sRNA DNA-analys indikerar att dessa organismer är släkt med Gammaproteobacteria . Initial 16sRNA fylogenetisk analys avslöjade inte några nära släktingar till Marinobacter hydrocarbonoclasticus . Därför placerades organismen i ett eget släkte, där forskare trodde att Pseudomonas aeruginosa var dess närmaste moderna släkting.
1999 visade 16S rDNA-sekvensanalys att Marinobacter hydrocarbonoclasticus hade en mycket nära släkting i Marinobacter aquaeolei . De två organismerna innehåller 16S rDNA-sekvenser med 99,4% likhet.
Organismerna från släktet Marinobacter har visat sig ha hög mångfald när det gäller de miljöer de lever i. Marinobacter- arter har upptäckts i "hypersalina bakteriemattor, marina varmvattenkällor i Japan, [och] kallt havsvatten som i arktiska och antarktiska regioner."
Morfologi och beskrivning
Marinobacter hydrocarbonoclasticus är gramnegativa och stavformade. Deras celler är i genomsnitt 0,3-0,6 µm i diameter och 2-3 µm långa. Deras förmåga att producera flageller är till stor del beroende av NaCl-koncentrationen i deras miljö. I lösningar med NaCl-koncentrationer på 0,6-1,5M Marinobacter hydrocarbonoclasticus och rör sig genom rörelsen av "ett enda ohantat polärt flagellum." I lösningar med NaCl-koncentrationer <0,2 eller >1,5 M. hydrocarbonoclasticus inte producera flageller och kan därmed inte påverka deras rörelse genom medium.
Ämnesomsättning
Marinobacter hydrocarbonoclasticus- celler innehåller inte cytokrom P450, som är nyckelenzymet för att bryta ned aromatiska ringar, en viktig komponent i petroleumkolväten. Dessa organismer är anpassade att växa på långa icke-cykliska alkaner, som är vanliga i petroleumkolväten. Celler kan växa på aromatiska kolväten, såsom kolväten som innehåller aromatiska ringar. Marinobacter hydrocarbonoclasticus är inte obligatoriska hydrocarbonoclastic organismer; de kan också växa på standardmedium, utan kolväten. Dessutom Marinobacter -celler denitrifiera och producera kvävgas. De kan använda antingen nitrat (NO 3 − ) eller nitrit (NO 2 − ) som sin slutväljare. Marinobacter hydrocarbonoclasticus -celler kan växa i aerobisk flytande mediumkultur och bilda kolonier på agar, vilket visar att de inte är obligatoriska anaerober.
Tillväxt, reproduktion och beteende
Marinobacter bildar diskreta välrunda kolonier på plattor, vilket indikerar att de reproducerar sig via binär fission. Marinobacter hydrocarbonoclasticus kan växa med eller utan närvaro av syre. Deras celler är toleranta mot höga salthalter. De kan växa upp till 3,5 molar NaCl, men växer bäst vid cirka 0,6 molar, vilket är molaren i Medelhavets havsvatten där de är isolerade. De kan växa som fritt plankton eller som fasta element i en biofilm . Marinobacter hydrocarbonoclasticus- celler bryter ned kolväten och utsöndrar osmoskyddande ektoin (Site du Genoscope). De utsöndrar också Petrobactin, "en bis-katekol α-hydroxisyrasiderofor som lätt genomgår en ljusmedierad dekarboxyleringsreaktion när den binds till Fe(III)."
Betydelse inom teknik och industri
Marinobacter hydrocarbonoclastus bryter ned petroleumkolväten, inklusive de som hittas i oceaniska oljeutsläpp. 2011 upptäcktes att Marinobacter hydrocarbonoclastus hämmas när de utsätts för kemikalien COREXIT EC9500A. Denna kemikalie är ett dispergeringsmedel som ofta används för att hjälpa till vid sanering efter utsläpp av havsolja. I sina tester erhöll Hamdan och Fuller (2011) data som tyder på att "vätenedbrytande bakterier hämmas av kemiska dispergeringsmedel, och att användningen av dispergeringsmedel har potential att minska miljöns förmåga att biosanera spill."
Marinobacter hydrocarbonoclasticus kan växa i flytande kultur och på agarplattor, där de producerade beige kolonier. De är toleranta mot hög salthalt och kan växa aerobt och anaerobt. Förmågan att växa i heterogena miljöer kan visa sig vara fördelaktig för forskare som söker nya, bakteriebaserade tekniker för att sanera oljeutsläpp i havet.