MED26

MED26-
identifierare
, CRSP7, CRSP70, medlarkomplex underenhet 26
externa ID:n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus
Med26-
PDB 1wjt EBI.jpg
lösningsstruktur för den n-terminala domänen i av mustranskriptionsförlängningsfaktor s-ii protein 3
Identifierare
Symbol Med26 N-terminal domän
Pfam PF08711
InterPro IPR017923
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Mediator underenhet 26
Mellandomänidentifierare
Symbol Med26_M
Pfam PF15694
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Mediator subenhet 26 C-terminal domän
Identifierare
Symbol Med26_C
Pfam PF15693
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Mediator av RNA-polymeras II-transkriptionssubenhet 26 är ett enzym som hos människor kodas av MED26 -genen . Det är en del av Mediator - komplexet .

Aktiveringen av gentranskription är en flerstegsprocess som utlöses av faktorer som känner igen transkriptionsförstärkarställen i DNA. Dessa faktorer arbetar med ko-aktivatorer för att styra transkriptionell initiering av RNA-polymeras II-apparaten. Proteinet som kodas av denna gen är en subenhet av CRSP-komplexet (kofaktor som krävs för SP1-aktivering), som tillsammans med TFIID krävs för effektiv aktivering av SP1. Detta protein är också en komponent i andra multisubunit-komplex, t.ex. sköldkörtelhormonreceptor-(TR-)-associerade proteiner som interagerar med TR och underlättar TR-funktionen på DNA-mallar i samband med initieringsfaktorer och kofaktorer.

Aktivitet

MED26 är en transkriptionsförlängningsfaktor som ökar den totala transkriptionshastigheten för RNA- polymeras II genom att reaktivera transkriptionsförlängningskomplex som har stoppat transkriptionen . Den gör detta genom att rekrytera ELL/EAF- och P-TEFb-innehållande komplex till promotorer via en direkt interaktion med den N-terminala domänen (NTD). MED26 NTD binder också TFIID, och TFIID och förlängningskomplex interagerar med MED26 genom överlappande bindningsställen. MED26 NTD kan fungera som en molekylär switch som bidrar till övergången av Pol II till produktiv förlängning.

De tre strukturella domänerna av TFIIS är konserverade från jäst till människa . De 80 eller så N-terminala resterna bildar en proteininteraktionsdomän som innehåller ett konserverat motiv, som har kallats LW- motivet på grund av de invarianta leucin- och tryptofanrester som det innehåller . Även om den N-terminala domänen inte behövs för transkriptionell aktivitet, har en liknande sekvens identifierats i andra transkriptionsfaktorer och proteiner som är övervägande nukleärt lokaliserade. Specifika exempel listas nedan:

  • MED26 (även känd som CRSP70 och ARC70), en subenhet av Mediator-komplexet, som krävs för aktiviteten av det förstärkarbindande proteinet Sp1.
  • Elongin A, en subenhet av en transkriptionsförlängningsfaktor tidigare känd som SIII. Det ökar transkriptionshastigheten genom att undertrycka övergående paus i förlängningskomplexet .
  • PPP1R10, en nukleär regulatorisk subenhet av proteinfosfatas 1 som tidigare var känd som p99, FB19 eller PNUTS.
  • , ett litet hypotetiskt protein som kan vara ett fosfoinositidbindande protein.
  • IWS1, som tros fungera i både transkriptionsinitiering och förlängning.
  • TFIIS, som räddar RNA-polymeras II från backtracked paustillstånd.

Den N-terminala domänen av MED26 är en proteinveckning känd som en TFIIS N-terminal domän (eller TND). Det är ett kompakt paket med fem helix. De hydrofoba kärnresterna i spiralerna 2, 3 och 4 är väl konserverade bland TFIIS-domäner, även om helix 1 är mindre konserverad.

Interaktioner

MED26 har visats interagera med MED8 , cyklinberoende kinas 8 , POLR2A , MED12 och MED28 . Det verkar också synergistiskt för att mediera interaktionen mellan REST (en Kruppel-typ zinkfinger transkriptionsfaktor som binder till ett 21-bp RE1 tystande element som finns i över 900 mänskliga gener) och Mediator.

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR017923

Vidare läsning