MATR3

MATR3
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ALS21, MPD2, VCPDM, matrin 3
Externa ID:n
Genontologi Molekylär
funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Matrin-3 är ett protein som hos människor kodas av MATR3 -genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen är lokaliserat i kärnmatrisen . Det kan spela en roll vid transkription eller kan interagera med andra nukleära matrisproteiner för att bilda det interna fibrogranulära nätverket. Två transkriptvarianter som kodar för samma protein har identifierats för denna gen.

Patologi

Mutationer i Matrin 3-genen är associerade med familjär amyotrofisk lateralskleros .

Vidare läsning

Stuurman N; Meijne AM; van der Pol AJ; et al. (1990). "Kärnmatrisen från celler av olika ursprung. Bevis för en gemensam uppsättning matrisproteiner" . J. Biol. Chem . 265 (10): 5460–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39383-4 . PMID 2180926 .
Andersson B; Wentland MA; Ricafrente JY; et al. (1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Anal. Biochem . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W; Andersson B; Worley KC; et al. (1997). "Storskalig sammanlänkning av cDNA-sekvensering" . Genome Res . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Okumara K; Nogami M; Matsushima Y; et al. (1998). "Kartering av humant DNA-bindande nukleärt protein (NP220) till kromosomband 2p13.1-p13.2 och dess relation till matrin 3" . Biosci. Biotechnol. Biochem . 62 (8): 1640–2. doi : 10.1271/bbb.62.1640 . PMID 9757574 .
Nagase T; Ishikawa K; Suyama M; et al. (1999). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna av oidentifierade mänskliga gener. XI. De kompletta sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA Res . 5 (5): 277–86. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452 .
Hu RM; Han ZG; Låt HD; et al. (2000). "Genuttrycksprofilering i den mänskliga hypotalamus-hypofys-binjureaxeln och cDNA-kloning i full längd" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
Zhang Z, Carmichael GG (2001). "Ödet för dsRNA i kärnan: ett p54(nrb)-innehållande komplex förmedlar kärnretentionen av promiskuöst A-till-I-redigerade RNA. " Cell . 106 (4): 465–75. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . PMID 11525732 . S2CID 18799711 .
Bernert G, Fountoulakis M, Lubec G (2003). "Mångfaldigt minskade proteinnivåer av matrin 3, minskat motorprotein HMP och hlark i fostrets Downs syndrom hjärna". Proteomik . 2 (12): 1752–7. doi : 10.1002/1615-9861(200212)2:12<1752::AID-PROT1752>3.0.CO;2-Y . PMID 12469345 . S2CID 32160196 .
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Zhang C; Dowd DR; Staal A; et al. (2003). "Nukleär koaktivator-62 kDa/Ski-interagerande protein är en nukleär matrisassocierad koaktivator som kan koppla vitamin D-receptormedierad transkription och RNA-splitsning" . J. Biol. Chem . 278 (37): 35325–36. doi : 10.1074/jbc.M305191200 . PMID 12840015 .
Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (2003). "hLodestar/HuF2 interagerar med CDC5L och är involverad i pre-mRNA splitsning". Biochem. Biophys. Res. Commun . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . doi : 10.1016/S0006-291X(03)01486-4 . PMID 12927788 .
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Beausoleil SA; Jedrychowski M; Schwartz D; et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; et al. (2005). "Mot en proteomskalakarta över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Lim J; Hao T; Shaw C; et al. (2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Olsen JV; Blagoev B; Gnad F; et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Ewing RM; Chu P; Elisma F; et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Valencia CA, Ju W, Liu R (2007). "Matrin 3 är ett Ca2+/kalmodulinbindande protein som klyvs av kaspaser". Biochem. Biophys. Res. Commun . 361 (2): 281–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2007.06.156 . PMID 17658460 .