Litet nukleolärt RNA snoR9
| Litet nukleolärt RNA snoR9 | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av snoR9-
| |
| identifierare | |
| Symbol | snoR9 |
| Rfam | RF00065 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; snRNA ; snoRNA ; CD-box |
| Domän(er) | Archaea |
| GÅ | GO:0006396 GO:0005730 |
| SÅ | SO:0000593 |
| PDB- strukturer | PDBe |
snoR9 är ett icke-kodande RNA (ncRNA) som fungerar i biogenes (modifiering) av andra små nukleära RNA (snRNA). Det är känt som ett litet nukleolärt RNA (snoRNA) och kallas också ofta för ett "guide-RNA".
R9 är en medlem av C/D-boxklassen av snoRNA som innehåller de konserverade sekvensmotiven kända som C-boxen (UGAUGA) och D-boxen (CUGA). De flesta av medlemmarna i box C/D-familjen fungerar i att styra platsspecifik 2'-O- metylering av substrat-RNA.
Detta snoRNA identifierades i en beräkningssökning efter GC-rika regioner i hypertermofilers AT-rika genom . Detta snoRNA är inte relaterat till växten snoRNA snoR9.
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (oktober 2002). "Renade Box C/D snoRNPs kan reproducera platsspecifik 2'-O-metylering av mål-RNA in vitro" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (19): 6663–6668. doi : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . PMC 134041 . PMID 12215523 .
- ^ Klein RJ, Misulovin Z, Eddy SR (2002). "Icke-kodande RNA-gener identifierade i AT-rika hypertermofiler" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (11): 7542–7. Bibcode : 2002PNAS...99.7542K . doi : 10.1073/pnas.112063799 . PMC 124278 . PMID 12032319 .
externa länkar