Lista över Drosophila-databaser

Forskning om modellorganismen Drosophila melanogaster har underlättats av utvecklingen av ett antal onlinedatabaser för lagring och kurering av vissa biologiska data.

DroID

Drosophila Interactions Database (DroID) är en onlinedatabas över Drosophila- gen- och proteininteraktioner. Den utvecklades av Russell L. Finleys laboratorium vid Wayne State University School of Medicine 2008 och har finansierats av National Human Genome Research Institute , National Institutes of Healths National Center for Research Resources, Michigan Proteome Consortium och Wayne State University.

FlyBase

FlyBase är den stora onlinedatabasen för forskare som arbetar med Drosophila . Den innehåller genomdata för olika Drosophila -arter, genkommentarer, genfunktionsförutsägelser och en mängd experimentella data som kan läggas över genomet. FlyBase utvecklades 1992 av Michael Ashburner vid University of Cambridge , men drivs nu av ett konsortium av grupper från Harvard University , University of Cambridge, Indiana University och University of New Mexico .

FlyFactorSurvey

FlyFactorSurvey är en databas med Drosophila- transkriptionsfaktorer som bestäms med hjälp av det bakteriella enhybridsystemet . Den utvecklades av Michael H. Brodskys och Scot Wolfes laboratorier vid University of Massachusetts Medical School 2011 och finansierades av National Human Genome Research Institute

FlyMine

FlyMine är en databas med transkription, proteinuttryck och andra proteindata för Drosophila- och Anopheles -arter. Den utvecklades ursprungligen av Gos Micklems grupp vid Cambridge University 2007. FlyMine finansieras främst av Wellcome Trust , med delar av databasen som stöds av National Human Genome Research Institute och Biotechnology and Biological Sciences Research Council .

I farten

OnTheFly är en databas med D. melanogaster- transkriptionsfaktorer och de DNA-sekvenser de binder. Det utvecklades av Barry Honigs laboratorium vid Columbia University Medical School 2013.

REDfly

REDfly (Regulatory Element Database) är en databas med Drosophila cis-regulatoriska element . Den utvecklades av Marc S. Halfons laboratorium vid University of Buffalo 2006 och har finansierats av National Science Foundation och National Institute of General Medical Sciences .