Liran Carmel

Liran Carmel
לירן כרמל
Född	7 augusti 1971 ( 1971-08-07 ) ( 51 år )
Nationalitet	israelisk
Alma mater	Tel-Aviv University , The Technion - Israel Institute of Technology, Weizmann Institute of Science
Känd för	Forskning inom molekylär evolution, mänsklig evolution, molekylär historia och forntida DNA.
Utmärkelser	Massry-priset (2021), Snyder Granadar-stol i genetik
Vetenskaplig karriär
Fält	Molekylär evolution
institutioner	Hebreiska universitetet i Jerusalem
Hemsida	carmelab .huji .ac .il

Liran Carmel (hebreiska: לירן כרמל, född 7 augusti 1971) är en israelisk vetenskapsman, professor i beräkningsbiologi vid Alexander Silberman Institute of Life Sciences, Hebrew University of Jerusalem . Carmel är Snyder Granadar Chair for Genetics och är 2021 års Massry- pristagare för sina studier inom området forntida DNA.

Biografi

Carmel är född och uppvuxen i Israel. Han studerade till en B.Sc. i fysik i Academic Atuda och tjänstgjorde i militären som fysiker i Rafael Advanced Defence Systems Ltd. Under sin militärtjänst fick han sin M.Sc. examen i kvantmekanik vid Technion - Israel Institute of Technology , under ledning av Ady Mann. Efter sin militärtjänst avslutade Carmel sin Ph.D. examen i matematik och datavetenskap vid Weizmann Institute of Science , under ledning av David Harel . I sin Ph.D. Carmel utvecklade algoritmer för luktkodning och digitalisering och var chef för algoritmteamet i ett företag som utvecklade medel för datoriserad luktöverföring. 2004 åkte Carmel till USA för postdoktorala studier vid National Institutes of Health (NIH) i Bethesda, Maryland , där han specialiserade sig på molekylär evolution i forskargruppen Eugene Koonin .

Carmel återvände till Israel 2008 och etablerade en forskningsgrupp för beräkningsbiologi vid avdelningen för genetik, Alexander Silberman Institute of Life Sciences, Hebrew University of Jerusalem . 2016 blev han inbjuden som senior gästprofessor till University of New South Wales i Sydney , Australien, där han tillbringade ett år.

Carmel är gift med Anat Gilad-Carmel, trebarnspappa, och bor i Shoham .

Forskning

Carmel studerar beräkningsmolekylär evolution och är särskilt intresserad av mänsklig evolution och forntida DNA . Han publicerade dussintals forskningsartiklar inom dessa områden.

2014 utvecklade han tillsammans med professor Eran Meshorer en beräkningsteknik för att rekonstruera genomomfattande kartor över DNA-metylering (en epigenetisk nyckelmekanism) från uråldriga DNA-sekvenser. Han tillämpade denna teknik på forntida DNA från Neanderthal och Denisovan , och var därmed den första att rekonstruera epigenetiska mönster av ålderdomliga människor och att identifiera gener som är differentiellt metylerade mellan ålderdomliga och moderna människor. Dessa gener inkluderar många som uttrycks i hjärnan och är associerade med neurologiska störningar som Alzheimers sjukdom , autism och schizofreni . Detta arbete valdes ut bland de tio bästa upptäckterna 2014 av arkeologitidningen .

Under 2017 utvecklade Carmel ett verktyg som identifierar organ och kroppsdelar som företrädesvis är berikade inom en uppsättning gener. Detta verktyg hjälper till att förstå hur människokroppen påverkas av förändringar i uttrycksnivåerna för gener. Genom att kombinera detta verktyg med sina studier av DNA-metyleringsmönster hos ålderdomliga människor, och tillsammans med professor Eran Meshorer, visade Carmel 2020 att den moderna människans röst- och ansiktsanatomi skiljer sig från den hos neandertalare och denisovaner, vilket pekar på fascinerande evolutionära processer under senaste hundratusentals år som påverkat den moderna mänskliga röstlådan.

Denisovans anatomi , eftersom dess bekräftade fysiska kvarlevor inkluderar ett finger, några tänder och en underkäke. Under 2019 utvecklade Carmel en beräkningsteknik som använder rekonstruerade DNA-metyleringskartor hos ålderdomliga människor tillsammans med medicinsk information om de fenotypiska effekterna av gener som ligger till grund för monogena sjukdomar, för att generera en anatomisk profil av ålderdomliga mänskliga grupper. Han tillämpade denna teknik på det uråldriga DNA från en flicka från Denisovan för att skapa en första anatomisk profil av dessa arkaiska människor. Detta arbete valdes ut bland de vetenskapliga genombrotten 2019 av Science , vann 1st People's Choice of Sciences genombrott 2019 och valdes ut bland årets 10 toppartiklar av Science News.

kanaanéernas genetik . I detta arbete sekvenserade han DNA från dussintals kanaanitiska individer som brukade leva i södra Levanten under bronsåldern , på platser som Megiddo och Hazor . Carmel fann att kanaanierna bildades som en blandning av lokalbefolkning med människor som kom från nordost, från regioner som idag inkluderar västra Iran och Kaukasus, och att processen fortsatte i hundratals år. Carmel fann också att de olika kanaanitiska populationerna över södra Levanten tillhörde samma genetiska population. I denna studie utvecklade Carmel en metod som han använde för att visa att de antika bronsålderspopulationerna från södra Levanten, Kaukasus och västra Iran i hög grad bidrog till genetiken hos dagens levantinska befolkningar som judiska grupper och arabisktalande grupper.

Pris och ära

• Carmel är 2021 års pristagare av Massry-priset , som han vann tillsammans med professorerna Svante Pääbo och David Reich , för sina bidrag till området forntida DNA.
• Michael Milken-priset 2019.

externa länkar

• Carmels hemsida vid Hebrew University.
• Liran Carmel vid Alexander Silberman Institute of Life Science
• Liran Carmel på Jerusalem Brain Community.
• Liran Carmel på Google Scholar.