Lipocalin 1

LCN1
Tillgängliga strukturer
PDB	Human UniProt-sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, PMFA, TLC, TP, VEGP, lipocalin 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa

Lipocalin-1 är ett protein som hos människor kodas av LCN1 -genen .

Proteinet som kodas av denna gen tillhör lipokalinfamiljen . Lipokaliner är en grupp extracellulära proteiner som kan binda lipofiler genom inneslutning i deras strukturer för att minimera lösningsmedelskontakt. Detta protein kan binda hydrofoba ligander och hämma cysteinproteinaser. Det kan också spela en roll i smakmottagningen.

Strukturera

NMR-struktur för LCN1

Proteiner klassificeras i lipocalin-familjen av deras 8 antiparallella beta-ark som bildar en cylinderstruktur som fungerar som bindningsställe för ligander.

Fungera

Lipocalin-1 (LCN1) kan binda en mängd olika lipofila molekyler tillsammans med zink- och kloridjoner. På grund av denna funktion tros LCN1:s huvudfunktion vara att avlägsna potentiellt skadliga lipider och lipofila molekyler från kroppen genom att binda dem. LCN1-Ligand-komplexet importeras sedan via Lipocalin-1-Interacting Membrane Receptor (LIMR) så att den bundna molekylen kan brytas ned på ett säkert sätt i cellen. Denna process för att hämta molekyler kan påverka flera processer inklusive feromonsignalering, immunodulation, inflammation , avgiftning, vävnadsutveckling, apoptos och mer.

LCN1 delar tre sekvensmotiv med cystatiner som gör att LCN1 kan agera på ett liknande sätt som cystatiner som en cysteinproteinashämmare. Dessa domäner har specifikt visat sig binda Papain .

LCN1 spelar också en roll för att stabilisera lipidskiktet i tårfilmen, även om detaljerna i detta ännu inte är väl förstått.

Historia

Lipocalin-1 ansågs ursprungligen produceras uteslutande av exokrina körtlar men har också hittats i kortikotrofer i hypofysen .

Alternativa namn: Human Tear Prealbumin, Tear Lipocalin, von Ebners körtelprotein

Klinisk

När en cell är under stress, på grund av inflammation, infektion eller annat, kommer den att producera förhöjda nivåer av lipokalin-1 (LCN1). Detta gör det till en potentiell icke-invasiv biomarkör för olika sjukdomar. Denna potential har visats i en studie av IVF -blastocyster , där förhöjda nivåer av LCN1 indikerade aneuploidi i blastocysten.

Vidare läsning

Glasgow BJ, Abduragimov AR, Gasymov OK, Yusifov TN (2003). "Triv lipocalin: struktur, funktion och molekylära verkningsmekanismer". Tårkörtel-, tårfilms- och torra ögonsyndrom 3 . Framsteg inom experimentell medicin och biologi. Vol. 506. s. 555–65. doi : 10.1007/978-1-4615-0717-8_78 . ISBN 978-1-4613-5208-2 . PMID 12613960 .
Redl B, Holzfeind P, Lottspeich F (oktober 1992). "cDNA-kloning och sekvensering avslöjar humant tårprealbumin vara en medlem av den lipofila ligandbärarproteinsuperfamiljen" . Journal of Biological Chemistry . 267 (28): 20282–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)88698-2 . PMID 1400345 .
Lassagne H, Nguyen VC, Mattei MG, Gachon AM (1995). "Tilldelning av LCN1 till human kromosom 9 är bekräftad" . Cytogenetik och cellgenetik . 71 (1): 104. doi : 10.1159/000134073 . PMID 7606920 .
Bläker M, Kock K, Ahlers C, Buck F, Schmale H (februari 1993). "Molekylär kloning av mänskligt von Ebners körtelprotein, en medlem av lipokalin-superfamiljen som uttrycks starkt i linguala spottkörtlar". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur och uttryck . 1172 (1–2): 131–7. doi : 10.1016/0167-4781(93)90279-m . PMID 7679926 .
Holzfeind P, Redl B (februari 1994). "Strukturell organisation av genen som kodar för humant lipocalin tår prealbumin och syntes av det rekombinanta proteinet i Escherichia coli". Gene . 139 (2): 177–83. doi : 10.1016/0378-1119(94)90752-8 . PMID 8112601 .
Lassagne H, Gachon AM (maj 1993). "Klonning av ett mänskligt lacrimal lipocalin som utsöndras i tårar". Experimentell ögonforskning . 56 (5): 605–9. doi : 10.1006/exer.1993.1075 . PMID 8500570 .
Holzfeind P, Merschak P, Rogatsch H, Culig Z, Feichtinger H, Klocker H, Redl B (oktober 1996). "Uttryck av genen för tårlipokalin/von Ebners körtelprotein i mänsklig prostata" . FEBS Bokstäver . 395 (2–3): 95–8. doi : 10.1016/0014-5793(96)01008-3 . PMID 8898072 . S2CID 22843813 .
van't Hof W, Blankenvoorde MF, Veerman EC, Amerongen AV (januari 1997). "Salivlipokalinet von Ebners körtelprotein är en cysteinproteinashämmare" . Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1837–41. doi : 10.1074/jbc.272.3.1837 . PMID 8999869 .
Redl B, Wojnar P, Ellemunter H, Feichtinger H (september 1998). "Identifiering av ett lipokalin i slemhinnekörtlar i det mänskliga trakeobronkialträdet och dess förbättrade utsöndring vid cystisk fibros". Laboratorieutredning; A Journal of Technical Methods and Pathology . 78 (9): 1121–9. PMID 9759656 .
Gasymov OK, Abduragimov AR, Yusifov TN, Glasgow BJ (november 1999). "Interaktion av tårlipokalin med lysozym och laktoferrin". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 265 (2): 322–5. doi : 10.1006/bbrc.1999.1668 . PMID 10558865 .
Wojnar P, Lechner M, Merschak P, Redl B (juni 2001). "Molekylär kloning av en ny lipocalin-1-interagerande human cellmembranreceptor med hjälp av fagdisplay" . Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 20206–12. doi : 10.1074/jbc.M101762200 . PMID 11287427 .
Wojnar P, van't Hof W, Merschak P, Lechner M, Redl B (oktober 2001). "Den N-terminala delen av rekombinant humant tårlipokalin/von Ebners körtelprotein ger cysteinproteinashämning beroende på närvaron av hela cystatinliknande sekvensmotiv". Biologisk kemi . 382 (10): 1515–20. doi : 10.1515/BC.2001.186 . PMID 11727836 . S2CID 44411516 .
Wojnar P, Dirnhofer S, Ladurner P, Berger P, Redl B (mars 2002). "Humant lipocalin-1, en fysiologisk renhållare av lipofila föreningar, produceras av kortikotrofer i hypofysen" . Journal of Histochemistry and Cytochemistry . 50 (3): 433–5. doi : 10.1177/002215540205000314 . PMID 11850445 .
Wojnar P, Lechner M, Redl B (maj 2003). "Antisense nedreglering av lipocalin-interagerande membranreceptoruttryck hämmar cellulär internalisering av lipocalin-1 i humana NT2-celler" . Journal of Biological Chemistry . 278 (18): 16209–15. doi : 10.1074/jbc.M210922200 . PMID 12591932 .
Glasgow BJ, Abduragimov AR, Gassymov OK, Yusifov TN, Ruth EC, Faull KF (2003). "E-vitamin associerat med lipokalinfraktionen av mänskliga tårar". Framsteg inom experimentell medicin och biologi . 506 (Pt A): 567–72. doi : 10.1007/978-1-4615-0717-8_79 . ISBN 978-1-4613-5208-2 . PMID 12613961 .
Tiffany JM, Nagyová B (2003). "Lipokalins roll för att bestämma tårarnas fysiska egenskaper". Tårkörtel-, tårfilms- och torra ögonsyndrom 3 . Framsteg inom experimentell medicin och biologi. Vol. 506. s. 581–5. doi : 10.1007/978-1-4615-0717-8_81 . ISBN 978-1-4613-5208-2 . PMID 12613963 .
Gasymov OK, Abduragimov AR, Yusifov TN, Glasgow BJ (oktober 2004). "Interstrand loopar CD och EF fungerar som pH-beroende grindar för att reglera fettsyraligandbindning i tårlipokalin". Biokemi . 43 (40): 12894–904. doi : 10.1021/bi049076o . PMID 15461462 .