La domän
La- | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
proteinidentifierare | |||||||||
Symbol | La | ||||||||
Pfam | PF05383 | ||||||||
InterPro | IPR006630 | ||||||||
SMART | TSPN | ||||||||
PROSITE | PDOC00280 | ||||||||
MEROPS | I75 | ||||||||
SCOP2 | 2mpr / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 1.B.3 | ||||||||
CDD | cd07323 | ||||||||
|
Inom molekylärbiologi är La-domänen en konserverad proteindomän .
Humana 60 kDa SS-A/Ro- ribonukleoproteiner (RNP) är sammansatta av en av de fyra små Y-RNA:erna och minst två proteiner , Ro60 och La . La-proteinet är en 47 kDa polypeptid som ofta fungerar som ett autoantigen vid systemisk lupus erythematosus och Sjögrens syndrom . I kärnan fungerar La som en RNA-polymeras III (RNAP III) transkriptionsfaktor , medan La i cytoplasman fungerar som en translationsfaktor . I kärnan binder La till 3'UTR av begynnande RNAP III- transkript för att hjälpa till med vikning och mognad. I cytoplasman känner La igen specifika klasser av mRNA som innehåller ett 5'-terminalt oligopyrimidin (5'TOP) motiv som är känt för att kontrollera proteinsyntesen . Den specifika igenkänningen förmedlas av den N-terminala domänen av La, som innefattar ett La-motiv och ett RNA-igenkänningsmotiv (RRM). La-motivet antar ett alfa/beta -veck som består av ett bevingat helix- motiv.
Homologa La-domän-innehållande proteiner har identifierats i ett brett spektrum av organismer förutom Archaea , bakterier och virus .