LRRC7

LRRC7
-identifierare
, DENSIN, leucinrik upprepning som innehåller 7
externa ID:n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Leucinrik repetition innehållande 7 även känd som LRRC7 , Densin-180 eller LAP1 är ett protein som hos människor kodas av LRRC7 - genen .

Strukturera

Befunnits vara tätt associerad med den postsynaptiska densiteten (PSD), den har karakteriserats som ett 188 kDa (ursprungligen tänkt att vara 180 kDa, därav nomenklatur), 1495 rester långt, hjärnspecifikt protein innehållande 16 leucinrika upprepningar (LRR) inom de 500 N-terminala resterna och en Psd95/Discs large/Zona occludens ( PDZ ) domän inom de 200 C-terminala resterna. Ursprungligen postulerade att ha en skenbar transmembrandomän, har det nu visats att proteinet har många fosforyleringsställen både N- och C-term av denna domän, och att proteinet därför är cytoplasmatiskt ; palmitoylering tros ske nära N-terminalen av proteinet, vilket skulle svara för lokalisering av proteinet vid PSD.

Interaktioner

LRRC7 har visats interagera med CDH2 .

De för närvarande exponerade interaktionerna av Densin-180 framställer proteinet som en promiskuös spelare bland viktiga synaptiska spelare, vilket passar in i den ursprungliga observationen av proteinets täta närvaro bland PSD-kärnproteiner av Mary B. Kennedy's Laboratory . Identifierade interaktionspartners inkluderar: CaMKII-alfa, alfa-Actinin och NR2B (via CaMKII-alpha), Cav1.3 (L-typ Ca2+) kanaler, MAGUIN-1, Shank, PSD-95 (via Shank och MAGUIN-1), beta-Catenin, delta-Catenins och NCadherin (via Cateninerna). Naturen och funktionen av dessa interaktioner, som beskrivs i tabellerna 1-1 och 1-2, framställer Densin-180 som en nyckelinteraktör mitt bland receptorproteiner, byggnadsställningsproteiner och strukturella proteiner. [antal källor - refererade i - Subcellulär lokalisering av rekombinanta Densin-180-kloner uttryckta i HEK293 TSA-celler Ranatunga, JM (2011) Subcellulär lokalisering av rekombinanta Densin-180-kloner uttryckta i HEK293 TSA-celler. Masteruppsats, UCL (University College London). http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/ ]

Det är också fullt möjligt att Densin-180 dimeriserar eller multimeriserar genom interaktioner mellan dess PDZ-domän och dess egna terminala aminosyrarester. [Subcellulär lokalisering av rekombinanta Densin-180-kloner uttryckta i HEK293 TSA-celler Ranatunga, JM (2011) Subcellulär lokalisering av rekombinanta Densin-180-kloner uttryckta i HEK293 TSA-celler. Masteruppsats, UCL (University College London). http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/ ]

Vidare läsning


Lägg till – en mycket detaljerad avhandling med preliminära experiment och teorier om funktionen av Densin-180 med titeln Subcellular localization of recombinant Densin-180 clones uttryckt i HEK293 TSA-celler http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/