Kromatinmonteringsfaktor 1

Steg i nukleosomsammansättning. CAF-1 visas i gult och interagerar med H3-H4-tetrameren.

Chromatin assembly factor-1 ( CAF-1 ) är ett proteinkomplex - inklusive Chaf1a (p150), Chaf1b (p60) och p48 subenheter hos människor, eller Cac1, Cac2 respektive Cac3 i jäst - som sätter ihop histontetramerer på replikerande DNA under S-fasen av cellcykeln.

Fungera

CAF-1 fungerar som en histonförmedlare som förmedlar det första steget i nukleosombildning genom att tetramerisera och deponera nysyntetiserad histon H3 / H4 på DNA snabbt bakom replikationsgafflar . H3 och H4 syntetiseras i cytoplasman. Flera studier har visat att interaktionen mellan CAF-1 och PCNA (prolifererande cellkärnantigen, som stabiliserar CAF-1 vid replikationsgafflar, är viktig för CAF-1:s roll i nukleosomsammansättningen

De tre underenheterna samverkar för att göra den komplexa funktionen. Den mänskliga subenheten (p150) interagerar med PCNA, som fungerar som en glidande klämma, för att hjälpa CAF-1-komplexet att interagera med DNA-replikationsgaffeln. Dessutom utför p150 tillsammans med PCNA nukleotidexcisionsreparation för att fixa eventuellt skadat DNA. P60 interagerar med ASF1a/b, som är en histonförföljare för H3/H4. p48 har roller utanför CAF-1, men när den är involverad i komplexet binder den till H4.

p60 attraherar ASF1a/b som är en chaperon för H3/H4 och detta är i komplexet med p150 som interagerar med PCNA för att fästa till replikationsgaffeln. CAF-1-komplexet lägger till histonerna till DNA:t före replikationsgaffeln.

En mutation i p150 som resulterar i en funktionsförlust skulle leda till dubbelsträngade brott, avbrott i replikationsgaffeln och translokationer. I p60 skulle förlust av funktion innebära att histonföraren för H3/H4 inte skulle interagera med komplexet. En mutation som denna i endera subenheten skulle resultera i funktionsförlust för CAF-1-komplexet som helhet. Men förlust av funktion i p48 skulle förändra hur väl komplexet kan chaperone kromatin, men skulle inte stoppa det som helhet.

Roller

CAF-1 krävs för rumslig organisation och epigenetisk märkning av heterokromatindomäner i pluripotenta embryonala celler, vilket skapar ett cellulärt minne av somatisk cellidentitet under cellulär differentiering .

Celler som liknar musembryon i 2-cellsstadiet ( totipotenta celler) kan induceras in vitro genom nedreglering av kromatinsammansättningsaktiviteten hos CAF-1 i embryonala stamceller .

CAF-1 bildar ett deadenylaskomplex med CCR4-Not , vilket inte bör förväxlas med det icke-relaterade CCR4 . CAF-1/CCR4-Not-komplexet samarbetar med frisättningsfaktorn eRF3 och PABPC1 för att förkorta poly(A)-svansen av mRNA under translation.

Vidare läsning

•    Cheloufi S, Elling U, Hopfgartner B, Jung YL, Murn J, Ninova M, et al. (december 2015). "Histonechaperonen CAF-1 skyddar somatisk cellidentitet" . Naturen . 528 (7581): 218–224. Bibcode : 2015Natur.528..218C . doi : 10.1038/nature15749 . PMC 4866648 . PMID 26659182 .
  • "Minnesförlust möjliggör produktion av stamceller" . ScienceDaily (Pressmeddelande). 9 december 2015.
•    Yu Z, Liu J, Deng WM, Jiao R (januari 2015). "Histone chaperone CAF-1: väsentliga roller i multicellulär organismutveckling". Cellulära och molekylära livsvetenskaper . 72 (2): 327–337. doi : 10.1007/s00018-014-1748-3 . PMID 25292338 . S2CID 18355941 .
•    Kaufman PD (september 2015). "Vill du programmera om? Skär ner på kromatinaggregatet!". Naturens strukturella & molekylära biologi . 22 (9): 648–650. doi : 10.1038/nsmb.3081 . PMID 26333710 . S2CID 33569420 .
•    Polo SE, Almouzni G (december 2015). "Kromatindynamik efter DNA-skada: arvet från access-repair-restore-modellen" . DNA reparation . 36 : 114–121. doi : 10.1016/j.dnarep.2015.09.014 . PMC 5113751 . PMID 26429064 .
•   Wang Z, Wu R, Nie Q, Bouchonville KJ, Diasio RB, Offer SM (mars 2021). "Kromatinmonteringsfaktor 1 undertrycker epigenetisk omprogrammering mot adaptiv läkemedelsresistens" . Journal of the National Cancer Center . 1 (1): 15–22. doi : 10.1016/j.jncc.2020.12.003 . S2CID 234287367 .
•    Sauer PV, Gu Y, Liu WH, Mattiroli F, Panne D, Luger K, Churchill ME (november 2018). "Mekanistiska insikter i histonavsättning och nukleosomsammansättning av kromatinmonteringsfaktor-1" . Nukleinsyraforskning . 46 (19): 9907–9917. doi : 10.1093/nar/gky823 . PMC 6212844 . PMID 30239791 .