Kinetisk klass (virologi)

En kinetisk klass , även känd som en temporal klass , är en gruppering av gener i ett viralt genom som uttrycks samtidigt under den virala replikationscykeln . Fem av de mänskliga DNA-virusfamiljerna har flera kinetiska klasser: Poxviridae , Herpesviridae , Adenoviridae , Papillomaviridae och Polyomaviridae . Alla gener i en viss kinetisk klass aktiveras av samma mekanism: antingen genom processen att viruset kommer in i cellen och avbeläggs, eller av produkterna från en tidigare kinetisk klass i vad som kallas en transkriptionskaskad . Generellt sett kodar tidigare kinetiska klasser för enzymer som styr den virala replikationsprocessen, och senare kinetiska klasser kodar för strukturella proteiner som ska paketeras i virioner

Virus med tre kinetiska klasser: Poxviridae, Herpesviridae och Adenoviridae

Flera namnscheman finns i virusfamiljer som har tre kinetiska klasser; vissa hänvisar till de tre klasserna som 1) omedelbart-tidigt 2) tidigt och 3) sent, och vissa hänvisar till dessa samma klasser som 1) tidigt 2) mellanliggande och 3) sent. Det tidigare namnschemat antas nedan eftersom det betonar den relativa likheten i funktion av de två första klasserna jämfört med den tredje.

Omedelbart-tidig klass

De första generna som uttrycks, i den omedelbara-tidiga klassen, förbereder viruset för replikering och skyddar det från värdförsvar. Dessa gener aktiveras i Poxvirus av enzymer förpackade i själva virionen. De är ansvariga för att lösa upp virionkapsiden, styra DNA-replikationen (i Poxvirus), skydda viruset från värdens interferon- och komplementförsvar (i Poxvirus) och aktivera den tidiga klassen av gener.

Tidig klass

Den andra klassen av gener fortsätter att bekämpa värdförsvar, stimulerar DNA-replikation (i Herpesvirus) och aktiverar den sena klassen. I herpesvirus är den tidiga klassen känd som beta-klassen och replikerar DNA-genomet med utgångspunkt från tre olika ursprung för replikation. I adenovirus består den av två transkriptionsenheter, IVa2 och IX.

Sen lektion

Den sena klassen består främst av strukturella proteiner och sammansättningsenzymer och är i alla tre familjerna beroende av den tidigare syntesen av virala DNA-kopior. I Herpesvirus, till exempel, består den sena klassen av gamma-1- och gamma-2-gener. Efter att den sena klassen har uttryckts kan virionerna samlas och lämna cellen.

Virus med två kinetiska klasser: Papillomaviridae och Polyomaviridae

Tidig klass

De tidiga proteinerna som produceras i papillomvirus och polyomavirus reglerar cellcykeln och aktiverar DNA-replikation. I papillomvirus kallas de E1 till E7 och stimulerar även cellulär replikation. I polyomavirus är de tidiga proteinerna T-antigener.

Sen lektion

De sena proteinerna utgör viruskapsiden. I polyomavirus är de kända som VP1, VP2 och VP3; i papillomvirus kallas de L1 och L2 (för "sena").