KDM1A
| KDM1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , AOF2, BHC110, KDM1, LSD1, CPRF, lysindemetylas 1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lysinspecifikt histondemetylas 1A (LSD1) även känt som lysin (K)-specifikt demetylas 1A (KDM1A) är ett protein hos människor som kodas av KDM1A- genen . LSD1 är ett flavinberoende monoaminoxidas , som kan demetylera mono- och dimetylerade lysiner , specifikt histon 3, lysiner 4 och 9 (H3K4 och H3K9). Detta enzym kan ha viktiga roller i embryogenes och vävnadsspecifik differentiering , såväl som oocyttillväxt. KDM1A var det första histondemetylaset som upptäcktes även om mer än 30 har beskrivits.
Strukturera
Denna gen kodar för ett nukleärt protein som innehåller en SWIRM-domän, ett FAD -bindande motiv och en aminoxidasdomän . Detta protein är en komponent i flera histondeacetylaskomplex , även om det tystar gener genom att fungera som ett histondemetylas.
Fungera
LSD1 (lysinspecifik demetylas 1), även känd som KDM1, är den första av flera proteinlysindemetylaser som upptäckts . Genom en FAD-beroende oxidativ reaktion tar LSD1 specifikt bort histon H3K4me2 till H3K4me1 eller H3K4me0. När man bildar ett komplex med androgenreceptorer (och möjligen andra nukleära hormonreceptorer ), ändrar LSD1 sina substrat till H3K9me2. Det är nu känt att LSD1-komplexet förmedlar en koordinerad histonmodifieringsväxling genom enzymatiska aktiviteter såväl som histonmodifieringsläsare i komplexet.
Funktionen av KDM1A-genen kan effektivt undersökas genom siRNA knockdown baserat på en oberoende validering.
Interaktioner
KDM1A har många olika bindningspartners, vilket kan vara nödvändigt för dess demetyleringsaktivitet. Vid akut myeloid leukemi (AML) visades GFI1B definitivt upprätthålla en interaktion med KDM1A som är nödvändig för spridningen av sjukdomen. Bevis för rollen av KDM1A-interaktioner med nukleär GSK3β för att främja progressionen av vissa cancerformer finns också. Höga nivåer av nukleär GSK3β visade sig främja bindningen av KDM1A till deubiquitinas, USP22, vilket förhindrar nedbrytning av KDM1A och får det att ackumuleras i högre nivåer. Ackumuleringen av KDM1A har korrelerats med tumörprogression i vissa cancerformer, inklusive glioblastom , leukemi och osteosarkom.
Klinisk signifikans
KDM1A verkar spela en viktig roll i den epigenetiska "omprogrammering" som uppstår när spermier och ägg samlas för att bilda en zygot. Borttagning av genen för KDM1A kan ha effekter på tillväxt och differentiering av embryonala stamceller . Deletion i musembryon är dödlig; embryon utvecklas inte längre än till dag 7.5. KDM1A tros också spela en roll vid cancer, eftersom sämre resultat kan korreleras med högre uttryck av denna gen. Därför kan hämningen av KDM1A vara en möjlig behandling för cancer. KDM1A tenderar att överuttryckas i tumörcellerna i vissa cancerformer såsom cancer i urinblåsan, lungan och kolorektal cancer. Specificiteten hos KDM1A-överuttryck i dessa cancerformer skapar potential för riktade molekylära terapibehandlingar, genom användning av KDM1A-specifika siRNA.
Mutationer
De novo-mutationer till KDM1A har rapporterats hos tre patienter, var och en med utvecklingsförseningar som tros delvis bero på mutationerna. Alla dokumenterade mutationer är missense-substitutioner. En av de drabbade familjerna har skapat en offentlig webbplats för att identifiera ytterligare fall.
Se även
externa länkar
- lysin+specifik+demetylas+1,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- Översikt över all strukturell information som finns tillgänglig i PDB för UniProt : O60341 (lysinspecifikt histondemetylas 1A) vid PDBe-KB .
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .