Jäst U1 spliceosomalt RNA

Jäst U1 spliceosomalt RNA
Jäst U1 spliceosomalt RNA
	Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av
U1_jästidentifierare
Symbol	U1_jäst
Rfam	RF00488
Övriga uppgifter
RNA -typ	Gen ; snRNA ; skarvning
Domän(er)	Eukaryota
GÅ	GO:0000368 GO:0030627 GO:0005685
SÅ	SO:0000391
PDB- strukturer	PDBe

U1 är en liten nukleär RNA (snRNA) komponent i spliceosomen och är involverad i pre-mRNA splitsning .

I splitsningsprocessen bildar 5' -änden av U1-snRNA:t komplementär basparning med 5'-splitsningsövergången för intronet som ska skäras ut, vilket definierar 5'-donatorstället för en intron.

Det finns signifikanta skillnader i sekvens och sekundär struktur mellan metazoan och U1 snRNA från jäst, varvid det senare är mycket längre (568 nukleotider jämfört med 164 nukleotider hos människa). Icke desto mindre antyder sekundära strukturförutsägelser att alla U1 snRNA delar en "gemensam kärna" bestående av helixar I, II, den proximala regionen av III och IV. Den sekundära strukturmodellen visar strukturförutsägelsen för de större jästsekvenserna.

^ Zwieb C (1997). "URNA-databasen" . Nucleic Acids Res . 25 (1): 102–3. doi : 10.1093/nar/25.1.102 . PMC 146409 . PMID 9016512 .
^ Kretzner L, Krol A, Rosbash M (1990). "Saccharomyces cerevisiae U1 liten nukleär RNA sekundär struktur innehåller både universella och jästspecifika domäner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (2): 851–5. doi : 10.1073/pnas.87.2.851 . PMC 53364 . PMID 2405391 .

externa länkar

Sida för jäst U1 spliceosomal RNA vid Rfam

[pmid9016512-1] Zwieb C (1997). "URNA-databasen" . Nucleic Acids Res . 25 (1): 102–3. doi : 10.1093/nar/25.1.102 . PMC 146409 . PMID 9016512 .

[pmid2405391-2] Kretzner L, Krol A, Rosbash M (1990). "Saccharomyces cerevisiae U1 liten nukleär RNA sekundär struktur innehåller både universella och jästspecifika domäner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (2): 851–5. doi : 10.1073/pnas.87.2.851 . PMC 53364 . PMID 2405391 .