Hunds circovirus
| Canine circovirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Monodnaviria |
| Rike: | Shotokuvirae |
| Provins: | Cressdnaviricota |
| Klass: | Arfiviricetes |
| Beställa: | Cirlivirales |
| Familj: | Circoviridae |
| Släkte: | Cirkovirus |
| Arter: |
Hunds circovirus
|
Canine circovirus (CaCV eller DogCV), som först isolerades 2012, är ett litet icke-hölje, ikosaedriskt, enkelsträngat DNA-virus som enbart infekterar tamhundar och vilda hunddjur. Det är en medlem av Circoviridae och släktet Circovirus . Det finns för närvarande 11 arter av kända circovirus som har identifierats påverka en mängd olika fåglar och däggdjur. Som sett med alla omfattande studerade circovirus varierar diametern mellan cirka 15 och 25 nanometer. Det ikosaedriska trianguleringstalet är 1, den minsta storleken som en viral kapsid kan vara, där det finns totalt 60 proteinsubenheter som utgör kapsiden. CaCV ska inte förväxlas med hundcoronavirus , ett annat diarréframkallande medel inom familjen Coronaviridae , eller svincirkovirus som är medlemmar av samma släkte som CaCV men som bara ses hos grisar. CaCV (genom 1) var det första Circovirus som identifierades som infekterade en annan däggdjursart än grisar.
Genom
Genomet av CaCV består av en enda cirkulär DNA-sträng som är 2 063 nukleotider lång. DNA i allmänhet består av fyra kvävebaser: adenin (A), tymin (T), cytosin (C) och guanin (G) där A parar med T och G parar med C över komplementära strängar i dubbelsträngat DNA och ibland i enkelsträngat DNA med en specifik sekvens som främjar basparning av samma sträng. CaCV uppvisar detta beteende i form av stamloopstrukturer. Guanin-Cytosinukleotidbasparning utgör lite över hälften av de totala paren som finns i CaCV och de vanligaste dinukleotiderna (när intilliggande nukleotider på samma sträng binder kovalent till varandra) är TG och GG. Genomet består av två kodande och två icke-kodande sektioner. Det finns bara två öppna läsramar (ORF) som kodar för specifika virala replikas- och kapsidproteiner. Virala replikasproteiner består av 303 aminosyror och den virala kapsiden är uppbyggd av 270 aminosyror. Genen som kodar för kapsiden innehåller sekvensen för 30 argininaminosyror som härrör från aminoterminalen. Denna ovanliga sträckning antas vara viktig för DNA-bindning. De två intergena icke-kodande delarna av genomet består av 135 och 203 nukleotider. Dessa regioner innehåller distinkta sekvenser för stamloopstrukturer, där det enkelsträngade DNA:t parar ihop sig och en ring bildas i slutet, såväl som segment av palindromer. Det finns en icke-kodande region mellan de två ORF:erna som innehåller en stamloopstruktur och sekvensen TAGTATTAC som används för initiering av genomreplikation. Ursprunget för replikationsstället (ori) är beläget inom den intergena regionen mellan de två kodande regionerna vid 5'-änden. De palindromiska sekvenserna är ett viktigt inslag där. En intressant anteckning om genomet av CaCV är att en av de intergeniska icke-kodande regionerna delar 91% nukleotididentitet med tallmårdtorque tenoviruset från familjen Anelloviridae, vilket ger bevis på ett möjligt evolutionärt samband mellan de två virusen.
Genomreplikation
Rullande cirkelreplikation är en metod för att replikera genom som ses vanligast i cirkulära plasmider och genom från bakterier och virus. Den viktiga proteindimeren som måste kodas för i DNA:t är replikationsproteinet, Rep. Rep klyver en plats av DNA:t som exponerar en fri 3' OH för viralt eller cellulärt polymeras att verka på. DNA-replikation sker i cellkärnan där detta virus är tillräckligt litet för att komma in i.
Symtom
Cirkovirus är allmänt kända för att vara ansvariga för potentiellt dödliga sjukdomar hos fåglar, grisar, fladdermöss, hundar, minkar och människor. Det finns för närvarande ingen litteratur om ett potentiellt vaccin mot viruset för hundar, men det finns ett som är verksamt för porcint circovirus. Symtom på CaCV inkluderar hemorragisk enterit som är associerad med plötslig försvagad aptit, kräkningar och blodig diarré. Dessutom har mikroskopisk analys identifierat vaskulit, eller inflammation i blodkärlen, och lymfoid nekros (misslyckande) hos drabbade djur. Organ som CaCV DNA har visat sig vara närvarande i inkluderar tarmarna, mjälten, lungorna, hjärnan, levern och lymfkörtlarna.
Samtidiga infektioner är också en vanlig förekomst hos djur som lider av CaCV. Hundsjuka och parvovirus (genotyp 2) var de vanligaste samsmittarna i en grupp tamhundar och andra vilda hunddjur som studerades 2016 av Zaccaria et al. Det misstänks också att yngre individer kan löpa större risk att utveckla livshotande symtom än vuxna djur, men det påståendet kan ännu inte göras vetenskapligt på grund av provtagningsbias. Ett botemedel mot CaCV är för närvarande okänd och behandlingen är ospecifik.
Fallstudier
I en artikel publicerad 2013 av Li et al. levern av en ung (1 år) tamhund av hankön analyserades med avseende på närvaron av ett smittämne. Hunden fördes till en början till University of California, Davis Veterinary Medical Teaching Hospital på grund av ökande förekomst av kräkningar, diarré och blod i avföringen (hematochezi). Hunden avlivades så småningom och ägaren gick med på att obduktionsprov skulle genomföras. Rutinmässiga tester för vanligare smittämnen som parvovirus, coronavirus och specifika typer av bakterier var negativa. Blödningar i hela mag-tarmkanalen och njurarna visades tillsammans med andra histologiska abnormiteter. Levervävnadsprover togs och virala nukleinsyror sekvenserades som innehöll specifika mönster som är karakteristiska för circovirus, vilket ger bevis för att CaCV är den enda dödsorsaken.
I samma artikel analyserades fekalt material från ett kohortprov av hundar med och utan diarré med användning av realtids-PCR-tekniker för att bestämma procentuell förekomst av circovirus. Det fanns ingen signifikant skillnad mellan identifieringen av CaCV-DNA hos hundar med diarré jämfört med de utan, men ytterligare data visade sig vara intressanta. Inom gruppen av hundar som testade positivt för CaCV hade 68 % av dem andra samtidiga infektioner av olika sjukdomar.
Det har funnits andra tidskriftsartiklar som har behandlat ett uppenbart samband mellan CaCV och andra samtidiga infektionsmedel. Thaiwong et al. lämnade in en publikation 2016 om en dubbelinfektionsincident av CaCV och hundparvovirus i en avelskoloni av hundar. Två sjukdomsutbrott inträffade i Michigan 2013 och 2014 där en grupp besläktade Papillon-hundar blev sjuka och några dog kort (inom 1 vecka) efter att symtomen började visa sig. Kropparna av hundarna som dog godkändes för nekroskopi. Tarmarna, mjälten och lymfkörtlarna var mest drabbade av missbildningar såsom segmentell slemhinnekollaps, villarförkortning, lymfoid nekros, lymfocytolys, multifokal granulomatös inflammation och histiocytos. Dessa händelser ledde till övergripande organsvikt och produktion av ovanliga slemsekret. PCR-analys och sekvensering av de behandlade organvävnaderna avslöjade stora mängder CaCV-DNA och hundparvovirus-2-DNA och antigener.
Andra studier har nämnt förekomsten av CaCV i andra länder än USA. En ytterligare artikel av Decaro et al. belyser ett utbrott av enteritsjukdom hos en valpkull i södra Italien. Två hundar dog inom en vecka efter infektion medan de andra var sjuka men kunde återhämta sig. En av kropparna genomgick laboratorieanalys och nekroskopi för att fastställa smittämnet. Genom att använda RT-PCR-tekniker och sekvensering testade lever- och tarmproverna positivt för närvaron av CaCV-replikasgenen. Alla andra patogener som screenades för kom upp negativa. Prevalensen av CaCV i Taiwan studerades också där hundar med diarré löpte ungefär tre gånger större risk att bli infekterade med CaCV än friska hundar. Detta kontrasterade studien som drivs av Li et al. i USA där hundar med diarré inte var mer benägna att vara CaCV-positiva.