Haloarculaceae

Haloarculaceae
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Archaea
Provins:	Euryarchaeota
Klass:	Halobakterier
Beställa:	Halobacteriales
Familj:	Haloarculaceae ; Gupta et al. 2016
Genera
	Halapricum; Haloarcula; Halococcoides; Haloglomus; Halomicroarcula; Halomikrobium; Halorhabdus; Halorientalis; Halosegnis; Halosiccatus; Halosimplex; Salinirussus;

Haloarculaceae är en familj av halofila och mestadels kemoorganotrofa archaea inom ordningen Halobacteriales . Typsläktet i denna familj är Haloarcula . Dess biokemiska egenskaper är desamma som ordningen Halobacteriales .

Namnet Haloarculaceae kommer från den latinska termen Haloarcula, som syftar på familjens typsläkte och suffixet "-ceae", en ändelse som används för att beteckna en familj. Tillsammans Haloarculaceae till en familj vars nomenklaturtyp är släktet Haloarcula .

Aktuell taxonomi och molekylära signaturer

Från och med 2021 innehåller Haloarculaceae 10 giltigt publicerade släkten. Denna familj kan molekylärt särskiljas från andra halobakterier genom närvaron av 19 konserverade signaturproteiner (CSPs) och sju konserverade signaturindelar (CSIs) närvarande i följande proteiner: acetylglutamatkinas , ribonukleas R, metallo-beta-laktamas , tRNA-modifierande enzym karbamoylfosfatsyntas stora subenheter och hypotetiska proteiner.

Fylogeni

Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI).

16S rRNA-baserad LTP _01_2022

53 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207

Halomarina *


	Salinirubellus *
		Halosegnis Duran-Viseras et al. 2022

Halocatena *


	Haloglomus Duran-Viseras, Sanchez-Porro & Ventosa 2020
		Natronomonas *

Haloarculaceae

Halosimplex Vreeland et al. 2003

Halorientalis Cui et al. 2011

Halapricum Song et al. 2014


	Halococcoides Sorokin et al. 2019
		Halorhabdus Waino et al. 2000

Salinibaculum *


	Salinirussus Cui et al. 2017
		Halovenus *

Halomicrobium Oren et al. 2002


	Halomicroarcula Echigo et al. 2013 (inkl. Halosiccatus )
		Haloarcula Torreblanca et al. 1986

Haloarculaceae

Halomarina *


	Haloglomus
		Natronomonas *

Halorientalis


	Halapricum
		Halorhabdus

Salinirussus


	Salinibaculum *
		Halovenus *

Halosimplex

Halomicrobium


	Halomicroarcula
		Haloarcula

Obs: * parafyletiska Halobacteriaceae

Se även

Lista över släkten Archaea

^ ^a ^b Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Fabros, Reena; Adeolu, Mobolaji (2016-02-02). "En fylogenomisk omvärdering av indelningar på familjenivå inom klassen Halobacteria: förslag att dela in ordningen Halobacteriales i familjerna Halobacteriaceae, Haloarculaceae fam. nov. och Halococcaceae fam. nov., och ordningen Haloferacales i familjerna Haloferacaceae och Haloferacaceae nov" . Antonie van Leeuwenhoek . 109 (4): 565–587. doi : 10.1007/s10482-016-0660-2 . ISSN 0003-6072 . PMID 26837779 . S2CID 254231068 .
^ Grant, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (2015-09-14). "Halobakterieklass. nov" . Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .
^ Oren, Aharon (2012-02-01). "Taxonomi av familjen Halobacteriaceae: ett paradigm för att förändra begrepp i prokaryot systematik" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 22155757 .
^ ^a ^b ^c J.P. Euzéby. "Haloarculaceae" . Lista över prokaryota namn med Standing in Nomenclature ( LPSN) . Hämtad 2021-11-17 .
^ Sayers; et al. "Haloarculaceae" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomidatabas . Hämtad 2022-06-05 .
^ "LTP" . Hämtad 23 februari 2022 .
^ "LTP_all-träd i newick-format" . Hämtad 23 februari 2022 .
^ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF) . Hämtad 23 februari 2022 .
^ "GTDB release 07-RS207" . Genomtaxonomidatabas . Hämtad 20 juni 2022 .
^ "ar53_r207.sp_labels" . Genom Taxonomy Database . Hämtad 20 juni 2022 .
^ "Taxonhistoria" . Genom Taxonomy Database . Hämtad 20 juni 2022 .

[:0-1] Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Fabros, Reena; Adeolu, Mobolaji (2016-02-02). "En fylogenomisk omvärdering av indelningar på familjenivå inom klassen Halobacteria: förslag att dela in ordningen Halobacteriales i familjerna Halobacteriaceae, Haloarculaceae fam. nov. och Halococcaceae fam. nov., och ordningen Haloferacales i familjerna Haloferacaceae och Haloferacaceae nov" . Antonie van Leeuwenhoek . 109 (4): 565–587. doi : 10.1007/s10482-016-0660-2 . ISSN 0003-6072 . PMID 26837779 . S2CID 254231068 .

[2] Grant, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (2015-09-14). "Halobakterieklass. nov" . Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .

[3] Oren, Aharon (2012-02-01). "Taxonomi av familjen Halobacteriaceae: ett paradigm för att förändra begrepp i prokaryot systematik" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 22155757 .

[LPSN-4] J.P. Euzéby. "Haloarculaceae" . Lista över prokaryota namn med Standing in Nomenclature ( LPSN) . Hämtad 2021-11-17 .

[NCBI-5] Sayers; et al. "Haloarculaceae" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomidatabas . Hämtad 2022-06-05 .

[6] "LTP" . Hämtad 23 februari 2022 .

[7] "LTP_all-träd i newick-format" . Hämtad 23 februari 2022 .

[8] "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF) . Hämtad 23 februari 2022 .

[about-9] "GTDB release 07-RS207" . Genomtaxonomidatabas . Hämtad 20 juni 2022 .

[tree-10] "ar53_r207.sp_labels" . Genom Taxonomy Database . Hämtad 20 juni 2022 .

[taxon_history-11] "Taxonhistoria" . Genom Taxonomy Database . Hämtad 20 juni 2022 .